非编码RNA(Non-codingRNA)是指不编码蛋白质的RNA,其中包括长非编码RNA(longnon-coding RNA,lncRNA),微小RNA(microRNA,miRNA),和环状RNA(circularRNA,circRNA)等多种已知功能的RNA,其在癌症生物学中发挥重要作用,为癌症干预提供了潜在的靶点。其中,circRNA作为一类新型内源性非编码RNA,呈共价闭环结构,既不具有5'至3'极性也不具有多腺苷酸化尾部,不易被核酸外切酶RNaseR降解,比线性RNA更稳定,具有高度保守性,部分具有快速的进化性改变。此外,部分circRNA分子含miRNA应答元件(miRNAresponse element,MRE),可充当竞争性内源RNA(ceRNA),与miRNA结合,在细胞中起到miRNA海绵的作用,进而解除miRNA对靶基因的抑制作用,上调靶基因的表达水平。因此,circRNAs可以作为有效的miRNA海绵,与miRNA相互作用调控基因表达。 近年来,环状RNA被证实参与发育过程,调节细胞功能,心脏病的发病机制,以及神经退行性疾病的发展,如阿尔茨海默病。在肿瘤发生与进展的研究中,就像miRNA在癌症中的广泛参与一样,circRNAs作为一个新兴领域,其表达谱和在癌症发生与进展中的作用受到了广泛的关注。最近,某些种类的circRNAs被发现在胃癌、结直肠癌,食管鳞状上皮癌中明显失调,并且参与了癌症发展。这些观察结果表明circRNAs可能是一种新型的潜在生物标志物和治疗癌症的靶点;然而,阐明解除管制的circRNAs并确定它们的功能仍是癌症研究中一个正在进行的过程。在这里我们分享一篇关于circRNA在肝癌(HCC)组织中表达谱的研究分析:该研究中,通过对公共数据库中癌症相关数据的分析,在细胞水平和动物水平的发现探讨并验证了circRNAcircMTO1在HCC中的作用及其潜在机制。 该研究首先利用芯片GSE97332(7对样本)分析了circRNA在HCC中的表达情况,筛选出在HCC肿瘤组织中表达量上调或下调最多的10个circRNAs(图1A),并在不同HCC患者中确定其表达情况,筛选出在HCC肿瘤组织中表达一致且明显下调的circMTO1(图B)。与其他在HCC肿瘤组织中低表达的circRNAs相比,只有沉默circMTO1才能显著促进HCC细胞增殖。此外,Kaplan-Meier生存曲线提示HCC中circMTO1表达降低与患者预后不良相关,circMTO1表达最有效的截断值为76.89,可能对HCC患者的预后预测有效(图2)。 图1
为了进一步研究circMTO1在HCC中可能的作用机制,该研究分析了与circMTO1相关的潜在miRNAs。利用RIPcircMTO1下拉实验,筛选miRanda数据库预测的circMTO1靶向miRNAs。结果发现与对照组相比,miR-9和circMTO1有特异性的富集(图3A-B)。荧光原位杂交(FISH)的分析结果表明,与癌旁组织相比,HCC肿瘤组织中circMTO1与miR-9在细胞质中的共定位有所降低(图3C)。以上结果证明circMTO1可以在细胞质中与miR-9结合。 图3 在体外成功构建了circMTO1沉默和过表达的HCC细胞模型,以研究circMTO1在HCC进展中的作用,及其与miR-9的相互作用(图4A)。细胞功能学相关实验结果表明下调circMTO1可显著促进肝癌细胞系HepG2和SMMC-7721的增殖(图4B)、侵袭(图4C),并抑制细胞凋亡(图4D),而上调circMTO1可促进肝癌细胞QGY-7701和SK-Hep1的凋亡(图4D)。此外,过表达miR-9与沉默circMTO1有相似的肿瘤促进作用(图4B-D)。 图4-1 图4-2 为了进一步探究circMTO1是否通过miR-9发挥其抗肿瘤效应,该作者检测了miR-9的靶向基因,肿瘤抑制因子p21的表达。如图4E-F所示,沉默circMTO1或转染miR-9 模拟物可显著降低肝癌细胞中p21的mRNA和蛋白表达水平;过表达circMTO1则得到与之相反的结果。此外,miR-9抑制剂可以显著缓解circMTO1沉默导致p21mRNA和蛋白表达的下调(图5A-C)。更重要的是,miR-9抑制剂阻断了肝癌细胞中沉默circMTO1介导的促进增殖和抑制细胞凋亡(图5D-E)。这些数据表明,circMTO1作为miR-9的海绵抑制HCC进展,并通过circMTO1/miR-9/p21轴消除miR-9致癌效应。 图5 在体内实验中,连续在瘤内注射circMTO1siRNAs后,携带HCC的SMMC-LTNM裸鼠中肿瘤生长明显加快,血清AFP显著增加(图6A-B)。此外,SMMC-LTNM裸鼠肿瘤组织中circMTO1、p21和下游CDK2的表达显著降低,细胞侵袭和增殖标志物MMP2和PCNA上调(图6C-D)。因此,circMTO1可以在体内抑制HCC的进展。 图6 该研究为大家探索circRNA在肿瘤发生和发展中的ceRNA作用机制提供了一个很好的思路;并且为验证circRNA和miRNA之间的相互作用机制提供了一些切实有效的研究方法。 参考文献:DanHan, Jiangxue Li, Huamin Wang, Xiaoping Su, Jin Hou, Yan Gu, etal.. Circular RNA MTO1 acts as the sponge of miR-9 tosuppress hepatocellular carcinoma progression. Hepatology. 2017, doi: 10.1002/hep.29270.
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