视频/图文教程，这是一篇有趣的技术干货！MedeA-VASP表面建模

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MedeA建模4-表面-CeO2(111)

实操讲解视频与理论资料相结合，

这是一篇有趣的技术干货！

从物理上来讲，表面是一种物质的新相。固体只有通过其表面才能与周围环境发生相互作用，表面对固体的物理化学特性有很大影响，因此研究表面性质至关重要。

不同晶面采用不同的密勒指数（hkl）表示，密勒指数是把晶面在三个坐标轴上的截距的倒数化为互质的整数。另外，创建表面结构必须以优化好的晶胞结构为基础来切面，表面切出后需要添加真空层，尽量减小垂直于平面方向上不同重复单元间相互作用，通常控制在10?以上。

Tools → InfoMaticA → Search

Require that formula: CeO2

Require that structural completeness complete → Run search

选中COD.9009008，点击右键→ View

 

右键Edit bonds →  Apply → OK

晶胞优化步骤见：MedeA计算1-晶胞优化

打开优化好的CeO2晶胞

File → Open structure from job → minimized.sci → Open

查看CeO2(111)面

View → Miller planes → h k l (1 1 1) → OK

切CeO2(111)表面：

Builders → Builder surface → Miler indices: h k l (1 1 1) → Search 

Repeats：根据最小板层重复单元厚度确定所需重复单元数

Gap：板层加真空层厚度

Angular tolerance：角公差

Repeats:2 Gap:10 → Create

Plane 0、Plane 1分别为上下表层

Update显示当前对称性和分子式。若删掉上下表层原子时，需要update确保此时分子式符合正确化学配比

调节Plane 0及Plane 1，确认表面暴露物种 → Update → OK

右键 → Edit bonds → OK

 

点击spreadsheet图标，显示CeO2-(111)元素、原子坐标等信息

当要考虑吸附、缺陷或掺杂模型时，需要更大的表面，此时可采用超胞创建工具来实现。

Builders → Builder supercell → a b c (2 2 1) → OK

右键Edit bonds → Apply → OK

 

补充：

1. 固定底层原子

研究表面性质时，由于底层原子对表面原子影响不大，通常将底层原子固定来减少计算量。

选中原子

2. 表面缺陷

选中原子 → Delete

例如氧空位：选中表面O原子→ Delete

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