一网打尽实验证实炎症ncRNA

NcRI(http://www./ncRI/)是一个人工挖掘炎症性疾病中实验证实的非编码RNA数据库，2020年六月发表在BMC Genomics。

数据库目前包含三个物种：人类、小鼠和大鼠；三个主要的非编码RNA类别：miRNA、lncRNA和其他非编码RNA。在人类中包含的miRNA、lncRNA和other ncRNA分别为1115、1202和82；在小鼠中包含的三种类别数目分别为647、59和26；在大鼠中包含的三种类别数目分别为218、148和0。在人类中包含254种疾病类型，在小鼠中包含115种疾病类型，在大鼠中包含41种疾病类型。

数据库一共分为查询、浏览、下载、提交和帮助5个模块。

查询模块：

在查询模块，用户可以单独输入非编码RNA或者疾病进行查询，也可以同时输入非编码RNA和疾病。这里以miR-155-5p和红斑狼疮为例进行查询。

 

在结果界面，可以得到非编码RNA和疾病的名字、非编码RNA的上下调信息、检测方法、通量信息、PMID和物种信息。用户可以对物种和通量进行筛选，此外还可以点击放大镜查看更多信息。这里以第一行为例。

 

在详细结果界面，用户可以得到包含分子机制在内的更多更详细的信息。

浏览模块：

用户可以通过点击和浏览选择感兴趣的非编码RNA和疾病进行查询。同样可以得到和查询模块一样的结果界面。

下载模块：

用户可以在下载模块下载数据库中包含的所有数据，包括人类数据、小鼠数据和大鼠数据。

提交模块：

如果用户有自己的实验数据，可以选择上传到此数据库，为数据库丰富内容。按照数据库的上传数据格式进行填写，最后点击submit就成功了。

帮助模块：

帮助界面描述的是数据库的详细使用方式。对于每一个模块有详细的描述和解释。

炎症一直被认为是感染性疾病发病、进展和结局的中心因素。众所周知，促进肿瘤的炎症（Tumor Promotion Inflammation）是癌症的十大特征之一。在过去数十年中，大量的研究证实了炎症反应和癌症发病机理之间的关系。

非编码RNA，如miRNAs和lncRNAs，已成为控制免疫和炎症过程的重要调控因子，在炎症疾病和免疫治疗中发挥着重要作用。

虽然文章影响因子不高，但是数据中的非编码RNA都是经过实验验证的。这个实验证实的炎症相关非编码RNA数据库，为我们进行疾病和肿瘤免疫分析提供了可靠的数据支持。近几年非编码RNA是申请各种基金的热点，如果对炎性noc-coding RNA感兴趣的可以联系我们的客服小姐姐为您打造个性化方案哦！

 

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