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3、进一步明确了人类遗传资源信息的范围,将临床数据、影像数据、蛋白质数据和代谢数据排除在人类遗传资源信息之外,为相关主体提供更好的实践指引。4、扩大了常见多基因疾病的人类遗传资源采集许可豁免范围,使得高血压、糖尿病等常见疾病的人类遗传资源采集不纳入重要遗传家系管理。申报人进入人类遗传资源信息管理备份平台:https://ngdc.cn... 阅32 转0 评0 公众公开 23-07-31 10:20 |
PubMedhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/PubMed是聚焦生物医学领域的免费文献检索数据库。值得注意的是,PubMed的文献搜索功能只能针对文献标题、摘要和关键词进行搜索,而不能对全文内容检索。GenBank是NIH基因序列数据库,是所有公开可用 DNA 序列的注释集合。GenBank、日本DNA数据库(DDBJ)和欧洲核苷酸序列数据集(ENA)三者共同构成国际核... 阅169 转4 评0 公众公开 22-07-13 14:06 |
人类基因组重测序研究利器。我们会通过重测序获得人类基因组上的变异数据,同时利用数据库搜索或注释方式,能够有效发现这些变异数据的位置信息、功能信息和临床疾病意义等。把测序数据中的SNP等变异数据在ClinVar数据库中搜索并进行变异分析,可以寻找出对应的基因变异信息,发生频率,表型,临床意义,评审状态以及染色体位置等。2、变异和位... 阅32 转0 评0 公众公开 22-03-19 23:15 |
代谢通路数据库汇总。这些通路包括代谢、药物以及疾病通路。他的资源包括13个细胞凋亡和细胞周期通路,3个细胞因子、生长因子与激素通路,5个细胞骨架和细胞外基质通路,20个基因调控与表达通路,2个描绘了G蛋白质复合物和核酸的相互作用的路径,2条与免疫信号和血液有关的路径,5个脂质细胞信号通路,4个多药耐药通路,12个神经生物学和神经传... 阅1 转自MITOMMY 公众公开 22-03-10 23:24 |
一网打尽实验证实炎症ncRNA.三个主要的非编码RNA类别:miRNA、lncRNA和其他非编码RNA。在查询模块,用户可以单独输入非编码RNA或者疾病进行查询,也可以同时输入非编码RNA和疾病。在结果界面,可以得到非编码RNA和疾病的名字、非编码RNA的上下调信息、检测方法、通量信息、PMID和物种信息。非编码RNA,如miRNAs和lncRNAs,已成为控制免疫和炎症... 阅261 转1 评0 公众公开 20-08-27 09:53 |
HPRD全称Human Protein Reference Database, 是一个专门存储人类蛋白质相互作用信息的数据库,和其他同类数据库相比,该数据库中存储的蛋白质互作信息都是经过实验验证的,而且数量上有明显优势。在文献中,对HPRD和其他数据库进行了比较,结果如下图片A表示不同数据库中存储的人类蛋白质相互作用的数据,从柱状图上可以明显看到,HPRD的数据量... 阅11 转0 评0 公众公开 20-08-13 09:06 |
Gencode数据库1. Gencode.ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gencode/Gencode_human.ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gencode/Gencode_human/release_32/gencode.v32.primary_assembly.annotation.gtf.gz我猜这个和上面那个注释文件信息是一样的。ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gencode/Gencode_human/release_32/gencode.v32.chr_pat... 阅1667 转6 评0 公众公开 20-02-22 17:15 |
四招教你用好在线生信资源,附最全的免费数据库!查询类资源大致可以分为核苷酸序列数据库、RNA序列数据库、蛋白质序列数据库、结构数据库、基因组学数据库(非脊椎动物)、代谢和信号通路数据库、人类和其他脊椎动物基因组数据库、人类基因和疾病数据库、微阵列数据和其他基因表达数据库、蛋白质组学资源数据库、其他分子生物学数据库、细胞器... 阅1004 转32 评0 公众公开 19-10-30 18:05 |
搜索框中键入HIF,找到该因子相关的通路。进入该通路,可以看到关于HIF-1信号通路的介绍:缺氧诱导因子1 (HIF-1)是一种转录因子,是调节氧稳态的主要因子。它由两个亚基组成:诱导表达的HIF -1α亚基和组成表达的HIF -1β亚基。尽管它的名字是HIF-1,但HIF-1的产生不仅是由于氧可获得性降低,而且还包括由其他刺激物,如一氧化氮或各种生长因子... 阅1519 转13 评0 公众公开 19-10-13 09:06 |
巧用数据库 | 我是如何使用NCBI,UCSC,Ensembl,Uniprot四个数据库的?blastx:核苷酸与蛋白序列比对,将给定的核酸序列按照六种阅读框架将其翻译成蛋白质与蛋白质数据库中的序列进行比对,对分析新序列和EST很有用;即有可能ENSMUST00000103114.2 version的信息在数据库当前的release(Current Ensembl release 97)中并不存在,ENSMUST00000... 阅3526 转47 评0 公众公开 19-07-26 09:36 |