【原】阿萨姆茶树不同器官中microRNA及其把基因

Characterizing microRNAs and their targets in different organs of Camellia sinensis var. assamica
阿萨姆茶树不同器官中microRNA及其把基因
*Genomics

为了全面注释茶树茶中的miRNA及其靶标，我们对9个茶树样品的小信使RNA进行了测序。 assamica（YK-10）是在中国西南地区广泛种植的二倍体优良品种。为了鉴定miRNA的靶标，我们分别从YK-10的叶子和根部测序了两个降解组测序图谱。通过分析小RNA-Seq图谱，我们在YK-10基因组中新鉴定了137个保守的miRNA和23个物种特异性的miRNA，从而显着改善了茶树中miRNA的注释。当比较研究中选择的三个器官中任意两个器官的RNA-Seq图谱时，鉴定出大约2000个不同表达的基因。在两个降解组谱中，总共鉴定出5000多个保守的miRNA靶标。此外，我们的结果表明，一些miRNA在茶氨酸，咖啡因和类黄酮的生物合成途径中起作用。这些结果增强了我们对茶树不同器官中小RNA指导基因调控的理解。