QPCR(枪头和离心管均无RNA酶) 提取细胞RNA 1. 细胞长满80%,弃培养基,冰PBS洗涤细胞2次空干(用枪吸尽PBS) 2. 加1ml冰TRizoL(大皿1.5ml 中皿1ml 六孔板500ul),吹打使细胞完全脱落, 吸入1.5ml EP管(无酶) 3. 加氯仿200ul,漩涡混匀器振荡15秒,室温静置5分钟 5. 吸取上层水相(勿吸入中间层)0.5-0.7ml移至另一1.5ml离心管中,加异丙醇0.5-0.7ml(1:1加入) 7. 弃上清,加75%冰乙醇(DEPC水)1ml, 颠倒混匀数次 8. 4℃ 12000rpm 5分钟 9. 弃上清, 吸干, 加DEPC处理去离子水10-20ul (视沉淀大小而定) 10. 测浓度(取5ul作RNA电泳,5ul作RNA定量,余-80℃冰箱保存) RNA鉴定:在紫外分光光度仪上测定RNA OD260/OD280均在1.8~2.0之间,表明抽提RNA纯度良好。 反转录反应: 1.去除基因组DNA:(0047A) 按下列组成配制反应混合液(冰上进行):
→离心→PCR仪(42℃ 2min 4℃ hold) 2.反转录反应:(037) 按下列组成配制反转录反应液(冰上进行):
→离心→PCR仪(42℃ 15min 85℃ 5s 4℃ hold 得到的cDNA于-20℃保存 PCR反应: 采用Real-time PCR技术分别检测各基因表达丰度。所有操作均在冰上完成,以β-actin为内参基因,引物均由上海生工设计并合成。每组设置3个复孔,不同标本的相对表达定量(RQ,Relative Quantity)值RQ=2-△CT。△Ct=目的基因Ct值-内参基因Ct值。详细步骤如下: 按下列组成配制PCR反应液:
使用ABI 7500 Real-Time PCR仪按以下条件进行PCR反应: 95℃ 30sec 预变性 1cycle 95℃ 5sec 60℃ 34sec PCR反应 40cycles |
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