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QPCR步骤(1)

 Doctor酸菜鱼 2020-12-24

QPCR枪头和离心管均无RNA)

提取细胞RNA

1. 细胞长满80%,弃培养基,冰PBS洗涤细胞2次空干用枪吸尽PBS)

2. 1mlTRizoL(大皿1.5ml 中皿1ml 六孔板500ul,吹打使细胞完全脱落,

吸入1.5ml  EP(无酶)

3. 加氯仿200ul,漩涡混匀器振荡15秒,室温静置5分钟
4.  4
  12000rpm  5分钟

5. 吸取上层水相(勿吸入中间层)0.5-0.7ml移至另一1.5ml离心管中,加异丙醇0.5-0.7ml1:1加入)
6.
充分混匀,冰盒上静置10分钟, 4  12000rpm  30分钟

7. 弃上清,75%冰乙醇(DEPC水)1ml, 颠倒混匀数次

8.  4  12000rpm  5分钟

9. 弃上清, 吸干, DEPC处理去离子水10-20ul (视沉淀大小而定)

10. 测浓度(取5ulRNA电泳,5ulRNA定量,余-80℃冰箱保存)

RNA鉴定:在紫外分光光度仪上测定RNA OD260/OD280均在1.82.0之间,表明抽提RNA纯度良好。

反转录反应

1.去除基因组DNA(0047A)

按下列组成配制反应混合液(冰上进行):

试剂                加入量

gDNA Eraser              1μl

5×gDNA Eraser Buffer          2μl

RNA                ≤1μg

RNase Free             补足至10μl

 →离心→PCR仪(42℃  2min    4℃ hold





2.反转录反应:(037)

按下列组成配制反转录反应液(冰上进行):

试剂                      加入量

PrimeScript RT Enzyme Mix I            1μl

5×PrimeScript Buffer 2for Real Time       4μl

RT Primer Mix                     1μl

RNase Free                      4μl

  →离心→PCR42℃ 15min

      85℃  5s      4℃  hold

  得到的cDNA-20℃保存




PCR反应:

采用Real-time PCR技术分别检测各基因表达丰度。所有操作均在冰上完成,以β-actin为内参基因,引物均由上海生工设计并合成。每组设置3个复孔,不同标本的相对表达定量(RQRelative Quantity)值RQ=2-△CT△Ct=目的基因Ct-内参基因Ct值。详细步骤如下:

按下列组成配制PCR反应液:

试剂                              加入量

TB Green Premix Ex Taq IITli RNaseH Plus)(  5μl

ROX Reference Dye II50×                 0.2μl

PCR Forward Primer10 μM                0.4μl 

PCR Reverse Primer10 μM                0.4μl

DNA 模板                            1μl

RNase Free                            3μl


 使用ABI 7500 Real-Time PCR仪按以下条件进行PCR反应:

      95℃ 30sec      预变性         1cycle     95℃ 5sec       60℃ 34sec      PCR反应     40cycles

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