讲逻辑太沉重,还是讲讲信号通路工具来调剂一下哈。其实仿佛几年前给你们讲过Pathway Commons,但现在再来看看,感觉已经不太一样了(现在想想一个能维持运营几年的工具,应该还不算差了)。 比如这个常用的工具PathViz就直接在首页上显示了: 输入一个或者多个基因,就能形成他们之间的Pathway关联网络图,比如P53和MDM2: 在Node间的Edge上,点击一下,就能显示两者关联的具体方式以及相关文献: 当然,PathViz只是Pathway Commons的一个工具,Pathway Commons主要的功能还是搜信号通路,比如我们还是搜一个P53: 也一样是这样的network图: 但具体的调控就变得更加细化了: 点击后就是一长串的文献证据: 或者只是点击含有P53的信号通路图,比如P53调控P21表达,就是这样的: 在步骤的节点上,也会显示出箭头反应的具体过程,以及相关文献: 总之在信号通路的浏览及搜索上,Pathway Commons还是挺有意思的一个工具。 好了,要也闲得无聊用一下信号通路分析的话,可以自己去百度一下,实在不行就回复“公克”(不要在评论区回复),要么就直接星球上见(当然,进不去也无所谓)。好吧,今天就先给你们策到这里吧,祝你们心明眼亮。 |
|
来自: Symphonizz0jez > 《待分类》