分享

文献精读分享

 医科研 2021-01-25

  

欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA、GEO, SEER数据挖掘。



文献1: Cancer cells exploit an orphan RNA to drive metastatic progression

  1. 肿瘤 Vs. 正常 (细胞系+组织+动物模型组织)small RNA-seq筛选 oncRNA 200+

  2. 高转移细胞系 Vs. 低转移细胞系筛选到最显著的T3p,  细胞系验证, TCGA验证

  3. 细胞+动物体内外功能验证

  4. 结合蛋白-T3p-miRNA-下游靶基因

  5. 外泌体smRNA-seq验证

  6. image.png
  7. T3p的预后诊断价值

  8. 启示: 外泌体分泌的non-coding RNA(除miRNA外)对肿瘤转移的影响。

文献2:Loss of XIST in Breast Cancer Activates MSN-c-Metand Reprograms Microglia via Exosomal miRNA to

Promote Brain Metastasis

  1. 筛选差异lncRNA并多数据集验证,找到XIST

    image.png
  2. 体内外功能试验验证XIST对脑转移的影响

    image.png
image.png
  1. Mammary-specific knockout of XIST促进脑转移

image.png
image.png
  1. XIST敲除对细胞功能的影响-EMT和细胞干性

image.png
  1. XIST低表达与转移相关的通路调节

image.png
image.png
  1. XIST低表达分泌外泌体miRNA诱导肿瘤微环境

image.png
image.png

文献3:Hypoxic exosomes facilitate bladder tumor growth and development through transferring long non-coding RNA-UCA1

  1. 缺氧外泌体介导的细胞功能影响

image.png
  1. 肿瘤细胞摄取外泌体

    image.png
  2. lncRNA在肿瘤细胞外泌体中的表达情况

image.png
  1. 体外验证外泌体lncRNA表达对细胞功能的影响

image.png
  1. 动物实验验证外泌体lncRNA对成瘤的影响

image.png
image.png
  1. lncRNA的预后诊断作用

image.png
  1. 启示外泌体分泌lncRNA也能参与肿瘤微环境塑造交流


本期内容就到这里,我是白介素2,下期再见,点击下方框框留言。

    转藏 分享 献花(0

    0条评论

    发表

    请遵守用户 评论公约

    类似文章 更多