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37个样本全部检查正确!北航联合华西医院研发结核低成本快速筛查技术,专为贫困偏远地区设计 | 专访

 zjshzq 2021-09-26


“这个小东西很好玩,一口唾沫,指头按两下,就可以知道你是否感染结核,以及是什么类型,” 中秋节前,常凌乾发了一条朋友圈。


从北京到成都,大约两千公里。路途虽远,北京航空航天大学教授常凌乾,却用自己团队的科研技术,帮助华西医院度过了 2020 年疫情伊始的核酸检测难题。

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图 | 常凌乾(来源:受访者)
 
如今,双方再次携手,这次他们要帮助的对方是四川大凉山贫困地区的结核病人。在那里,结核病依然比较严重,且已成为一种致命疾病。
 
经过一年多的研发和验证,常凌乾制造出一种低成本、便携式的微流控装置,并给其命名为 Fd-MC(finger-driven disposable micro-platform )
 
它具有低成本、便携、手指驱动等优点,并搭载重组酶聚合酶核酸等温扩增技术,集核酸提取、扩 增、检测于一体,可对痰液样本中的结核杆菌实现便携现场快速检测。只需动动手指,就能在一个完全分离的微通道中,完成完整的结核病诊断过程。
 
要想判断是否患有这种疾病,就得进行结核杆菌检测,这时就需要大型核酸检测设备。但是在乡村卫生院和基层诊所,往往没有这个条件。
 
结核病,是由结核分枝杆菌引起的传染病,也是致死率最高的单传染病原体之一。据世界卫生组织统计,2019 年结核病导致 1000 多万新感染病例,140 万人死亡。因此,快速准确诊断疑似结核病携带者的方法,仍然是抑制其传播的关键。
 
在四川当地,老百姓要做常规性结核病筛查,一般要到设备齐全的三级医院,只有那里才有商用核酸检测仪器。但这种仪器价格昂贵,对实验室和专业人员的要求都比较高,因此很难应用在偏远地区。
 
此外,尽管商用核酸检测仪器已被证明具有临床可接受的特异性和敏感性。然而,这些系统的一个共同缺点是,它们的实验室环境需要在样品制备、核酸扩增和检测后,由熟练的操作人员在相对复杂的过程中操作。
 
这两个因素都阻碍了它们在结核病死亡的偏远地区的使用。因此,迫切需要设计低成本、易于操作且准确的平台来弥合这一差距。
 
在此之前,常凌乾一直和华西医院合作核酸检测项目。看到这一需求之后,常凌乾研发了上述这种既不需要电,也不需要额外设备,此外还得价格便宜、测试快速,总之一切都要以简单为主。
 
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图 | 相关论文(来源:受访者)


日前,相关论文已由合作双方发在 Biosensors &Bioelectrnics(IF: 10.7)上,论文题为 《基于等温扩增的手指驱动一次性微平台在结核病多点诊断中的应用》(A finger-driven disposable micro-platform  based on isothermal amplification for the application of multiplexed and point-of-care diagnosis of tuberculosis) 。第一作者是北航博士生王之莹,共同作者是北航王杨副教授,共同通讯作者分别是北航常凌乾教授、以及华西医院检验科主任应斌武教授。

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图 | 本次论文第一作者王之莹(来源:受访者)

可摆脱对电力、外部泵的依赖
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Fd-MC 大约有手掌那么大,长度 55mm、宽度 66mm、厚度 5mm,上面有一个直径 1.6mm 的样品注入孔,还有两个用于存储相应缓冲液的圆柱形腔,以及用于 DNA 提取的微通道。
 
芯片基底采用聚甲基丙烯酸甲酯(PMMA)进行激光刻蚀,并在缓冲液储存室的上表面覆盖弹性膜。当按压弹性膜时,可直接驱动液体在微流道中流动,从而可摆脱对电力、外部泵的依赖。
 
此外,在芯片上设计了 “W” 形通道的 DNA 提取区,并在内部填充二氧化硅颗粒,基于二氧化硅对病原体的核酸进行固相萃取。当样品进入到微通道与硅粒子混合时,在高浓度的盐离子作用下,样品中带负电荷的 DNA 分子通过阳离子盐桥与硅粒子结合,从而被吸附于二氧化硅珠上。

研究中,常凌乾采用基于 FAM 探针的原位荧光策略,通过手持式紫外灯,可用肉眼读取芯片的结果。因此在避免感染或环境污染的风险方面,Fd-MC 具有独特的优势。
 
在检测区,常凌乾设计了 5 个平行的“y形”反应区 “y形” 反应区由 “y形” 通道和圆柱形腔室组成,每个 “y形” 腔室由一个小的通道连接。一旦液体进入检测区域,将首先填满 “y形” 通道,直到装置被轻微摇晃才会流入到装载有 RPA 反应物的圆柱形腔室。这种设计可以建立一个物理分区,允许每个室形成一个独立的环境,避免液体流动造成的交叉污染。
 
该团队在多重检测中,针对人型结核分枝杆菌(MTB)、 结 核 分 枝 杆 菌 复 合 群(MTBC)、分枝杆菌(MB),分别设计 RPA 特异性引物。该芯片不仅能识别结核/非结核感染,还能区分人结核分枝杆菌/牛结核分枝杆菌。

图片图 | Fd-MC(来源:受访者)

在操作时,把经过前处理的痰液或者咽拭子加到进样口,依次用手指按压两个弹性膜。然后,将芯片置于 37-42℃ 的温度,20 分钟之内即可实现核酸等温扩增。测试完之后,将芯片置于设计的小型读取设备中,并用手机 App 进行拍照,通过荧光显色,表明受测者是否患有结核,甚至还能检测结核的亚型。
 
总的来说,Fd-MC 能够实现芯片上的 “样本输入和结果输出”,集成了包括从结核病病原体中提取 DNA、基于 RPA(重组酶聚合酶扩增)的荧光可视化的多个操作步骤。
 
图片图 | 基于核酸等温扩增的手指驱动式微流控芯片(Fd-MC)快速检测结核杆菌的原理示意图(来源:受访者)

37 个样本,全部检查正确
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Fd-MC 通过 37 个临床样本进行了验证,包括奇美拉分枝杆菌、鸟分枝杆菌、胞内分枝杆菌、戈登分枝杆菌和脓肿分枝杆菌,以及由中国四川大学华西医院提供的 20 份临床阳性痰样本,和健康志愿者们捐赠的 10 份健康痰样本。所有临床样本均经华西医院经伦理批准确认。
 
验证结果表明,与商业实时荧光 RPA 相比,在对 37 个临床样本的检测中,Fd-MC 获得了 100% 的特异性(指正确检测阴性样本的能力),敏感度(指正确检测阳性样本的能力)为 95.2%。

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图 | Fd-MC 对临床结核病样本诊断的验证(来源:受访者)

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