|
背景介绍 最近在分析一些组学数据，所以就把相关的内容都在翻着看！那么我们推文的核心还是以绘图为主，所以就来一篇关于基因富集分析（GO、KEGG）图的制作。 Metascape是一个为基因提供功能注释的网站工具，网站不仅更新及时，而且操作简单，分析较快，对于组学研究来说确实是一个不可多得的实用工具。 软件介绍 [软件名称]：Metascape [软件网址]：https:///  使用教程 1.打开网站，可以在方框中输入数据，也可以直接select file输入数据，旁边有例子，也可以用例子自己先摸索一下  默认分析 2.这里我输入几个我自己实验的基因（RNA-seq的差异基因，你也可以是网络药理获得的基因），选择输入的物种（我这里是大鼠Rattus norvegicus），然后点击Express Analysis  3.软件分析中  4.点击分析报告  5.然后这里就可以看到所有富集出来的信息，在最上方，点击就可以下载对应的文件（Excel文件，PPT文件），下方的则为网页版报告  6.里面就包含了GO和KEGG富集结果  7.下载文件包括以下三种格式  8.还有对应的蛋白互作网络  9.下载下来的PPT文件也是非常精美，结果完美呈现，直接使用在文章中即可（记得添加参考文献）。  10.表格包括注释  11.以及相应的功能富集，也可以自己用来作图 选择性分析 12.当然，你也可以选择自己仅需要的分析，那么点击Custom Analyasis 13.点击富集，选择GO的三个MF，BP，CC，以及KEGG通路分析，上面的参数自己可以根据实际情况调节一下，然后选择富集分析 14.然后就分析完成了 15.点击查看富集结果 16.然后就跟上述一样，查看对应的结果即可 17.赶紧来试试吧！ |
|
|
