|
2021年8月26日，丁香园推出“病原微生物研究的钥匙：“NGS实际应用思路详解”主题课程探因医学mNGS临床应用专家洪登伟老师受特邀，精彩讲授“再讨论 mNGS 技术在临床的应用与发展”，回顾mNGS在临床的应用现状，剖析该技术目前存在的问题并展望其未来发展方向。  感染性疾病是造成人类死亡的重要因素，明确病原是与感染性疾病斗争的关键。目前临床常用病原检测技术存在准确性低、阳性率低、检测周期长、病原覆盖面窄等局限，无法完全满足临床病原检测的需求。因此，不依赖于传统培养就能全面、快速获得样本中全部类型微生物信息的mNGS技术成为了临床检测病原微生物的有力工具。近年来，mNGS应用于临床的研究呈爆发式增长，探因医学联手复旦大学附属中山医院感染病科胡必杰团队在Small Methods上(IF=12.13)发表题为“High-Throughput Metagenomics for Identification of Pathogens in the Clinical Settings”的综述，对mNGS病原检测方法学及临床应用研究进行了系统总结，对mNGS在临床上的应用发挥指导性作用。同时，相关专家共识也快速发展，覆盖mNGS临床应用范围、基本流程和管理要求以及报告解读等方方面面。  洪登伟老师表示，尽管已有专家共识对mNGS技术在感染性疾病病原检测上的应用提出规范化的要求，但目前该技术在临床应用中仍面临人源背景占比高、真菌与胞内菌检出困难、微生物核酸污染、定植菌与致病菌的区分困难以及临床意义准确解读等诸多挑战。如人源背景占比过高对检测性能有较大影响，在核酸提取环节去除人源宿主核酸能够有效提高病原核酸提取效率。现有人源核酸去除技术主要有物理法、目标捕获法、差异裂解法等。差异裂解发如优化得当，可获得更好的效果。探因医学自主研发的病原体核酸富集技术(MicroRich)，在前处理阶段去除人源核酸，反向富集病原微生物核酸，尤其适用于多种样本类型，可实现良好的病原富集效果。  不仅仅是检测技术本身的灵敏度，在取样、运输以及实验等各阶段均可能发生污染，也会极大的影响检测结果的临床意义。因此检验机构有否效控制各类干扰因素，客观呈现样本真实情况也同样重要。探因医学以“评价检测结果假阴性”、“评价检测结果假阳性”、“评价结果解读能力”三项满分的好成绩顺利通过“全国下呼吸道感染宏基因组测序室间质量评价预研活动”。  此外，通过对外周血mNGS检测结果的深入分析，帮助临床正确理解检测结果的真实含义。他表示，目前外周血mNGS的主流是检测cfDNA，但单独检测cfDNA无法判断病原微生物是否真实入血、不能明确诊断是血流感染还是局部病灶感染。针对这个难题，探因医学研发出“译血原exactBlood”，通过对血液样本中游离病原体进行捕获富集，合并cfDNA与游离病原体双流线检测流程，全面提升外周血检测敏感度、准确判断病原体是否入血，从而帮助临床获得更为明确的检测结果的临床意义。  最后，洪老师在展望mNGS的发展方向时提出，技术本身会朝着灵敏度、特异性提升、成本降低的方向发展；检测机构会与临床进一步碰撞，整合出更多像“译血原”这样的、更能帮助临床精准诊断的新技术，从而进一步为特殊患者定制更合适的诊疗方案；同时，检测机构也会进一步的规范化发展、会帮助临床对mNGS提供的结果进行多维度的、更深入的挖掘，从而会更好的解决临床问题。 探因医学 探因医学科技有限公司是专注于病原微生物临床分子诊断产品研发和mNGS临床测序服务的高科技企业，其核心团队在早期便进入国内病原体宏基因组二代测序临床应用领域。公司已在上海、广州等多地设立医学检验实验室，业务范围覆盖北京、上海、广东等全国多个区域，已与全国300余家三甲医院开展临床与科研合作，科研项目达百余项，团队已发表SCI高影响因子文章数篇。在国家临检中心组织的全国下呼吸道感染宏基因组测序室间质量评价中，探因医学斩获三项满分。作为国内病原微生物检测领域的先驱者，探因医学将始终坚持“探渊寻隐，识原明因”的信念，与临床专家共同努力一道攻克病原体精准诊断的技术难点，用先进的医疗产品与服务为大众的健康保驾护航。 |
|
|
