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2021年8月26日,丁香园推出“病原微生物研究的钥匙:“NGS实际应用思路详解”主题课程探因医学mNGS临床应用专家洪登伟老师受特邀,精彩讲授“再讨论 mNGS 技术在临床的应用与发展”,回顾mNGS在临床的应用现状,剖析该技术目前存在的问题并展望其未来发展方向。探因医学自主研发的病原体核酸富集技术(MicroRich),在前处理阶段去除人源核酸,反...
NGS应用探究|病原微生物。· 病原微生物耐药性研究。NGS 在病原微生物中检测主要采用两种方案,即rRNA基因测序和宏基因组测序。而宏基因组与rRNA基因测序相比,可获取的信息更加全面,更适合用于复杂临床标本中的病原微生物鉴定[3]。宏基因组测序(mNGS)通过NGS技术直接从临床样本中获取全部的核酸(DNA和RNA)序列,进一步与各个物种(...
分枝杆菌中含有丰富且种类繁多的脂质,细胞壁由 60% 的脂质组成,例如 C-分枝杆菌糖脂、糖肽脂、酚糖脂、含海藻糖的脂多糖、硫脂、阿拉伯甘露聚糖脂和分枝菌酸等。总共分析了经过WGS分析的273株分枝杆菌,其中包括244株结核分枝杆菌复合群(MTB)和29株非结核分枝杆菌(NTM)。图1. 分枝杆菌的分析流程:具有正负两种离子模式的 MALDI-TOF质谱仪(...
【当月主编】质谱技术在分枝杆菌菌种鉴定中的临床价值。担任中华医学会结核病学分会结核病临床检验专业常务委员;中华医学会结核病学分会基础学组委员;中国防痨协会结核病基础专业分会委员 、天津市防痨协会检验专业常务委员、天津市生物医学工程学会医学生物技术专业委员会委员 ;白求恩精神研究会检验医学会感染性疾病检验与临床专业委员会...
mNGS在病原体检测中的应用。传统 PCR 检测技术的瓶颈是需要根据已知病原体序列信息预先设计引物,而mNGS能够对临床样本中的所有核酸序列进行无偏倚测序,能快速鉴定新发病原体。mNGS 技术极大地增强了罕见病原体的检出能力,弥补常规检测方法不能覆盖罕见病原体的不足,例如巴氏阿米巴导致的脑膜炎、尿液中检出日本脑炎病毒、血液中检出沙眼衣...
欧洲临床抗菌药物敏感实验委员会(EUCAST)华人抗菌药物敏感实验(ChiCAS)分委会主任委员,欧洲临床微生物感染疾病学会(ESCMID)合作实验室主任,世界华人检验舆病理医师协会副会长,国家卫生计生委抗菌药物临床应用与细菌耐药评价专家委员委员兼办公室主任,国家卫计委合理用药专家委员会抗菌药物组副组长,国家卫计委全国细菌耐药监测网质...
有6篇文章报道了他们对大型乳腺癌数据的研究结果:TCGA(癌症和肿瘤基因图谱计划)对来自507名患者的510份样本进行了外显子组测序6,Banerji对103个样本进行外显子组测序,对46个样本进行了全基因组测序8,Stephens对100个样本进行了外显子组测序,Shah对65个样本进行全基因组/外显子组测序,对80个样本进行RNA测序12,Nik-Zaina对21个肿瘤/正...
二代测序(next-generation sequencing,NGS)技术又称高通量测序技术,是不依赖于传统微生物培养方法而明确样本中所有微生物分类及功能的检测技术,与已经成为临床DNA测序标准方法的桑格测序相比,NGS技术更高效,可在较短的时间内以较低的成本获得大量信息[2]。3NGS在儿童下呼吸道感染病原检测中的应用3.1 快速的细菌检测 采用NGS技术进...
二代测序相比一代测序大幅降低了成本,保持了较高准确性,并且大幅降低了测序时间,将一个人类基因组从3年降为1周以内,但在序列读长方面比起第一代测序技术则要短很多,这也给三代测序提供了发展空间。RADseq (Restriction-site associated DNA sequencing)是在第二代测序基础上发展而来的一项基于全基因组酶切位点的简化的基因组测序技术,对...
学习时间丨测序技术简介及对比——二代测序▍内容参考/优医智库▍作者/学者 方海英。图 2每百万碱基DNA序列测序成本演变[3]对于大规模的基因组测序来说,2011年时间点上,桑格测序法的平均成本为每百万碱基约500美元,而二代测序已经将平均测序成本压到了每百万碱基0.5美元以下[4]。图 3常见二代测序技术解决方案流程说明[7]其次,相比起一代测...
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