【原】再论如何用Windows电脑玩转序列比对（Blast）

Blast是序列比对最常用的方法~

可惜，网络版blast太慢，服务器版Blast又对硬件有要求。

如果能用自己的笔记本跑序列比对就太好啦~

昨天的帖子，和大家讨论了如何用windos电脑玩转Blast《什么？我可以用windows电脑玩Blast？》

当时提到，白璧微瑕，文中的方案依旧缺少了鼠标点点的可视化界面。结果，感谢好友们留言，一下子提供了2种解决方案。笔者亲身测试了一下，都很不错，这里就继续和大家分享一下

方法一：Tbtools

这是用公众号“生信石头”（原名：生信札记）的大佬Chen老师开发的一款Java工具。其中就包含了图形化的Blast运行工具。

视频 | TBtools 入门指北 ~ 暑期上手，就在此时！

该工具的下载网址为：

https://github.com/CJ-Chen/TBtools/releases

点击windows版本的exe下载后双击安装即可。

界面也非常清晰，功能一目了然

方案二：Kablammo

这是一款在线工具，专门提供blast结果的图形化展示的

http://kablammo./

操作也非常的简单，点击”“Load Results”上传比对结果后，等待页面展示

这里需要提醒大家注意的是：上传的blast结果需要是xml格式的，其他的格式并不支持呢~

如何获得xml的比对结果呢？比对时增加参数“-outfmt 5”。我贴个示例程序给大家一看就明白了

blastn -db blastdb -query Genome1 -out blast.xml -outfmt 5

怎么样？这两个工具都很有趣吧

感谢好友们的无私分享，特别鸣谢陈新飞同学的贡献。

希望大家继续分享点评好用的好玩的工具~

微信号：

Mypathogen

微微悦明

科学的乐趣是获得新知识的喜悦

高通量测序、大数据

病原微生物检测和监测

健康大数据行业资讯记录与分享

每一天获得一点微小的收获和进步。小确幸的科研也很好。与君共勉！