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如何快准狠设计PCR引物?(primerbank)

 十六_ 2022-07-28 发布于浙江

1、文献中的方法中找

2、引物银行中找(这些一般是文献中用过的)

1)、进入Pubmed,https://www.ncbi.nlm./pubmed?holding=icnxsmllib

2)、输入基因名字:如:Gene:IDO

3)、如果需要的是人源的

从图中可以查出对应的基因的名字和ID号

4)、进入引物银行:https://pga.mgh./primerbank/

5)、它可能会同时给出几个引物供你参考

6)、挑出引物,去primer blast中检测一下,primer blast会给出这对引物可能的产物,如果别的产物长度和你的目的基因的长度相似,那么这对引物就要舍弃。

这一步就是检测引物的可用性。

3、自己设计

1)、去NCBI中自己设计:https://www.ncbi.nlm./pubmed?holding=icnxsmllib

2)、输入基因的NM号/基因名

3)、点击箭头所指

4)、找到CDs(该基因的CDNA),复制到primer blast,让其设计出引物,然后重新blast一下引物的可用性既可。

个人拙见,有问题可以问我。

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