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做为一种质子泵抑制剂而言，奥美拉唑具有抑制胃黏膜壁细胞的质子泵分泌胃酸的作用，在临床上是一种常见的抑制胃酸分泌的药物。 人体的胃酸和消化酶在正常的情况下是不会对自身的胃肠黏膜产生侵蚀，但是如果机体的胃肠黏膜的防御体系受到损害，胃酸分泌过多的话，就会发生胃溃疡或者十二指肠溃疡，在这种情况下也就需要使用药物来降低胃内酸度和消化酶的活性，避免胃黏膜受损，而常用的质子汞抑制剂主要有以下的几种：奥美拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑。
此类质子汞抑制剂抑制胃酸分泌的原理如下：胃酸由胃黏膜壁细胞的质子汞介导，将壁细胞内的H+汞出到胃腔，将K+汞入到壁细胞内，因此质子汞是壁细胞分泌酸的最关键环节，而质子泵抑制剂的作用就是与质子汞结合，抑制H+K+ATP酶的活性，抑制胃酸的分泌。
但是胃肠是我们人体消化吸收食物的主要器官，如果没有胃酸和消化酶的共同作用，我们人体将会无法消化食物，而且消化酶的活性也要在酸性的环境下才能够维持，许多长期服用奥美拉唑的人都会产生嗳气以及饱胀感的状况，这其实也是因胃酸的分泌受到抑制，胃部没有足够多的胃酸进化消化食物的原因。
通常一次口服奥美拉唑20mg，6小时内胃酸的分泌就会停止，而24小时内胃酸的分泌减少60-70％。 因此长期服用奥美拉唑抑制胃酸分泌有可能会导致胃黏膜功能受损，胃粘膜萎缩，使人患上慢性萎缩性胃炎，引起B族维生素缺乏症、巨幼细胞性贫血或者缺铁性贫血。
因此在使用奥美拉唑治疗消化道溃疡时，疗程最好是控制在三个月内，最好采用最小有效剂量、最短的疗程，达到治疗目的后要及时停用，要在医师指导下规律正确的服用。
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