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【推文汇总】GO和KEGG富集分析及可视化

 生信交流平台 2023-02-18 发布于上海

前面给大家汇总了
 【推文汇总】基于TCGA数据库的数据挖掘

今天小编再为大家整理一下截至目前为止在生信交流平台微信公众号上发表过的与GO和KEGG富集分析及可视化相关的文章,方便大家学习和查找。

R代码进行富集分析并可视化

☞GO简介及GO富集结果解读

Gene Ontology(GO)简介与使用介绍

☞四种GO富集柱形图、气泡图解读

☞GO富集分析四种风格展示结果—柱形图,气泡图

☞ KEGG富集分析—柱形图,气泡图,通路图

【R语言】clusterProfilerf富集分析,物种注释数据库

【R】气泡图和柱形图展示挑选的KEGG通路

☞ R四种风格展示挑选的GO富集结果

GO和KEGG富集结果如何显示基因symbol

GO和KEGG富集倍数(Fold Enrichment)如何计算

GSEA分析

 GSEA数据集介绍

 基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)

 从GSEA官网下载缺氧(hypoxia)相关基因

基因富集工具DAVID

1.基因富集工具DAVID介绍(一)-基因ID转换
2.基因富集工具DAVID介绍(二)-KEGG富集分析
3.基因富集工具DAVID介绍(三)-零代码展示KEGG富集结果
4.基因富集工具DAVID介绍(四)-GO富集分析及柱形图展示

5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG

6.零代码GO富集分析—一张图展示BP,MF,CC

7.【R】四种风格展示DAVID GO富集分析结果

8.【R语言】DAVID KEGG富集分析结果可视化

9.展示DAVID富集分析结果中感兴趣的GO条目和KEGG通路

八卦图

 circleplot展示GO富集分析结果

 【实战】circleplot展示GO富集分析结果—附R代码

【R语言】circleplot展示KEGG富集分析结果

弦图

 GO富集分析弦图怎么看

 【R语言】绘制GO富集分析弦图

 【实战】R语言绘制GO富集分析弦图

R绘制KEGG富集弦图

常见报错解决办法

 加载R包org.Hs.eg.db出错,避坑指南!

 KEGG富集分析一直报错,粉丝拯救了我!

 【R语言】解决GO富集分析绘图,标签重叠问题

我们也将上面的内容整理成了系统的线上培训课程,方便大家学习!

 GO和KEGG富集分析视频讲解

 DAVID进行GO/KEGG富集分析及结果可视化

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