约莫一个月前,不知为何,突然收到好几个朋友问了一些TBtools的使用问题。按照我个人的设想,TBtools的使用应该不会存在使用问题。从开放使用至今,几乎没有停止过接受用户的反馈和改进。感谢TBtools的用户群体,大家一起让TBtools成为更实用的生信下游数据分析外挂小工具。
等繁杂而简单的事情上。而这些分析目前均在TBtools上有一定程度的实现,因为他们的原理极其简单,但是操作却非常耗时。使用TBtools,用户完全可以在极其短的时间内掌握并使用。 GO 和 KEGG 的 富集分析其实最普遍的操作,只是一个超几何分布的检验,更或者说,使用Fisher's Exact。TBtools很早就支持GO 和 KEGG的富集分析,以下仅展示使用的文件,而不会涉及这些文件的获取(因为往往现在大多数公司均提供非常廉价的分析服务,结题报告中有这些信息)。 GO 富集分析需要准备三个文件
准备好文件之后,直接使用TBtools即可,点击Start摁钮,等到完成富集分析 富集分析结构信息比较多,如果没有接触过的朋友,可直接只查看.final.xls文件 完成了富集分析,那么我们就可以对富集分析结果进行可视化 非常快,在点击Start之后,就会弹出 这个对话框中,几乎所有元件都可以按照分组统一调整,包括字体,大小,颜色等...随后可以保存为SVG或者PDF等矢量图 KEGG富集分析...已经过了14点30分了,差不多要去果园采荔枝了估计,就先不写了。 写在后面最近我报名了8月份在成都的全国植物基因组学会议, 由于学校报账制度的问题,似乎无法请款用于参会。 故, 欢迎各位朋友打赏,多多益善最后的最后,欢迎**懒得阅读Manual**的朋友,参加TBtools课程,详细见 |
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