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病例分享第78期I 通过实例如何结合临床评估BF NGS结果

 医学abeycd 2023-07-17 发布于湖北

武汉市肺科医院呼吸与危重症医学科II病区病例分享第78期

近期经常碰到同行给我一个BF NGS结果,有检出NTM+Mtb的,有一堆病原体的,有少见病原体的等等,如今随着mNGS及tNGS的如火如荼,临床如何解读,不同的组织出了不少专家共识及指南,有专家说有些病原体检出即使序列数很低也应确诊,有专家说NGS一点都不可靠,有专家说NGS阴性排除感染价值非常高,有专家看到啥菌都治疗......。只想说NGS是对于临床来说确实一利器,但如何利用这利器,另外如何不被这利器带偏,需要我们对每个患者均进行综合分析,污染、定植、致病、实验室质控永远难以用标准去明确,此时考验的就是您对每一例患者的所有检查结果的综合分析。78期即和大家分享一例外院BF mNGS结果的在院患者。

病史简介:

患者,女,70岁   入院时间:2023.6.15

主诉:间断咳嗽3月余,加重20余天

现病史:患者3月余前无明显诱因出现咳嗽,咳白痰,无发热、盗汗,无胸闷、胸痛,就诊于当地人民医院,查胸部CT(2023.5.21)报告示双肺感染。2023.5.29气管镜:支气管粘膜呈炎性改变,外送NGS检出新型隐球菌273copies/ml、白念珠菌11063copies/ml,热带念珠菌5059copies/ml,克柔念珠菌1804copies/ml,新型冠状病毒核酸阳性,予抗感染(莫西沙星、舒普深)、化痰治疗,症状好转出院,建议上级医院诊治。4天前患者至部级三甲医院复查胸部CT(2023.6.11)示双肺见多发斑片状及结节状高密度影,右下肺为著,右侧胸腔积液,考虑肺部感染;门诊结合外院NGS给与氟康唑抗真菌治疗,患者至我科门诊,建议住院。

自发病以来,患者精神、食欲、睡眠一般,大小便正常,体重较前无明显下降。

既往史:冠心病病史,目前口服阿司匹林100mg qd,酒石酸美托洛尔12.5mg qd。否认肝炎、结核、疟疾史;否认高血压、糖尿病史;否认脑血管疾病史;否认输血史、外伤史、手术史;否认药物、食物过敏史。

体格检查:体温36.1℃,脉搏82次/分,呼吸20次/分,血压160/83mmHg。神志清楚,全身皮肤粘膜无黄染及出血点,浅表淋巴结未触及肿大,双侧瞳孔等大等圆,对光反射灵敏,伸舌居中,颈软,右肺呼吸音粗,右肺闻及湿罗音,心律齐,未闻及病理性杂音,腹软,无压痛及反跳痛,双下肢无水肿,病理征阴性。

辅助检查:2023.5.21至2023.6.4当地人民医院出院小结:2023-05-22新型冠状病毒核酸检测:新型冠状病毒ORF1ab基因32.65,新型冠状病毒N基因29.81;痰STB(-)。胸部CT(2023.5.21)示双肺感染。2023-5-29支气管镜:支气管粘膜呈炎性改变。呼吸道多重病原体靶向测序(tNGS):白念珠菌(+),热带念珠菌(+),库德里阿兹威毕赤酵母(克柔念珠菌)(+),新型隐球菌(+)。-5-29全腹部CT平扫:1、肝左叶外侧段(S3段)类圆形稍低密度影,必要时进一步增强检查。2、肝脏多发小囊肿。3、腹主动脉及髂总动脉壁钙化。4、右下肺感染。2023-6-1全腹部CT增强:肝左叶小血管瘤 2、肝脏小囊肿。3、腹主动脉钙化。4右下肺大片高密度影考虑为感染。

某省部级三甲医院:胸部CT(2023.6.11)示双肺见多发斑片状及结节状高密度影,右下肺为著,右侧胸腔积液

入院检查:心电图:窦性心动过缓。PCT <0.040 ng/ml,ESR 24.00 mm/h ↑,血常规正常。凝血全套未见异常。 尿液分析:LEU 3+ ↑, 血浆D-二聚体测定:DD 1.96 mg/L ↑。大便常规未见异常。 hs-CRP 0.58 mg/L。生化全项未见异常。 痰STB(-) 3次,痰TBDNA阴性。 心肌酶2项:CK 47.50 U/L、CK-MB 8.80 U/L。HBV,HCV,HIV,梅毒阴性。肿瘤标志物:CEA正常,AFP正常,细胞角蛋白3.71ng/ml(正常值<3.3ng/ml),NSE正常。PPD 5u:10*10mm。2023-06-16 肺部增强CT(报告):右肺下叶显示散在的大片状阴景影,密度不均,中间有多发小虫蚀状透亮区阴影。左肺上叶见斑片状混杂密度影,部分病灶边界模糊不清。气管支气管腔通畅。诊断意见:右肺下叶和左上叶继发性肺结核。不排除右下病灶为机化性肺炎。

外院气管镜结果:支气管粘膜呈炎性改变

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外院BF NGS结果:

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省部级三甲医院2023.6.11胸部CT

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我院2023.6.16胸部HRCT增强

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