(用最简单的方式靠自己发生信SCI!) (朋友圈里有更多科研干货) 生信技能学习,是现在科研最好的自我投资! 生信SCI需要多少实验量? 生信SCI目前“干湿结合”是个大趋势了。肿瘤的必备实验验证,最少也需要qPCR。 “重磅 | 国自然的前期基础的生信SCI该怎么发?——1区生信SCI范例”给大家更新从0到国自然水平对应IF需要哪些实验: 1)收集患者的组织和相应的对照组织,通过免疫组化和免疫荧光或WB方法检测基因的蛋白表达情况。 2)细胞功能验证,干扰或过表达目标基因,检测细胞功能(也叫表型)变化。 3)需要在动物模型中干扰或过表达目标基因,然后检测动物中的功能指标变化。 4)机制实验属于拔高阶段,更多出现于高分文章中,一般3-5分文章做机制的还比较少见。并且,生信 验证这类干湿结合思路,并不是以验证实验为主体,所以一般也不会做的很深入,即使涉及到一些机制也更多是简单的通路验证。 看看最近刚发表的几篇生信SCI,不同的研究方向,不同IF,对应需要多少实验量? step 1:肿瘤方向 简单来说就是GEO筛选差异miRNA,再经过NB,SVM,RF等筛选。 qPCR(血清样本量不少,64 LUAD patients and 59 normal individuals)在这里也用来筛选了而不是明确靶标后的验证。 最后再结合PCA和AUC指标评估选出2个miRNA(miR-5100 and miR-663a)是LUAD合适的潜在靶点。 肿瘤的普遍都有简单实验验证,如qPCR。 IF高一些的,已经开始有功能实验。 step 2:非肿瘤方向 而差不多IF的非肿瘤小众疾病(类固醇诱导的股骨头坏死(SONFH)),还停留“纯生信”水平。 pyroptosis-related(热点) GEO,GO/KEGG,PPI,ROC等筛选。生信分析也比较简单。不过发表对应的期刊也比较小众(BMC Musculoskelet Disord肌肉骨骼疾病),是疾病针对性期刊。 3 的纯生信,多了molecular docking 而同个期刊,差不多同时发表,但是疾病是cancer,实验有cck-8, Scratch, transwell, invasion assays,好多功能实验。只能说肿瘤相比非肿瘤,太卷了。 step 3:建议 非肿瘤的向肿瘤看齐就行。肿瘤的则要比目前发表的再多一些,这样才有竞争优势。 再就是无论肿瘤还是非肿瘤,多关注自己疾病方向对应的期刊,这样好命中一些;再就是生信分析还得多出创新点才好发。尤其是最新发出的纯生信文章,是学习模仿的最佳资料。 小结:生信这门技能,科研的应用越来越广!而越年轻的时候,能否有一些SCI打基础,对未来的发展差别还是很明显的,越早做打算越好,加油! 独学而无友则孤陋而寡闻,转发给你关心的朋友们~ 一对一生信SCI指导(付费),添加个人号kyzd2019请备注:生信SCI(可先关注朋友圈,大致了解项目后再咨询) 附录:生信SCI流程 生信SCI完整流程 新的一对一指导已更新(单击查看详情),一对一指导自发布之日起施行,此前一对一指导内容与本项目介绍有不一致的,以最新的一对一指导为准。 由于纯个人原因没有空/一直拖延3个月及以上未完成作业/交流的老学员,因为行情一直在变,这边占用一对一指导名额的老学员均不再安排退出机制(不能老占着名额不学习哈),以最新一对一指导为准。 |
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