外科黄文斌 IP属地:广东

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ccRCC中TRAF2的上调与临床预后不良有关研究者使用热图分析5个模型组成基因(TRAF2、CD7、MFSD1、NFKB2和BCAT1)的表达模式,发现TRAF2的差异表达在5个基因中最为显著,并且在几乎所有高危患者样本中均上调(图 4A)。TRAF2在ccRCC细胞中促进细胞增殖、迁移和侵袭研究者通过RT-qPCR(图 5A)和Western Blot检测(图 5B)证实TRAF2在OSRC2和CAKI2...
POLA2在肝细胞癌中的过表达参与免疫浸润并预测预后不良。图1 来自 TCGA 数据库的 POLA1 和 POLA2 在 HCC 中的表达分析02 - POLA1或POLA2在HCC中的生存预后分析为了评估POLA1和POLA2对生存预后的影响,研究人员将HCC病例按其POLA1和POLA2 mRNA水平分为高、低两组。图8 POLA2 与 HCC 中免疫细胞浸润的关系POLA2与免疫细胞标志基因的相关性研究结...
生信SCI需要多少实验量?看看最近刚发表的几篇生信SCI,不同的研究方向,不同IF,对应需要多少实验量?而差不多IF的非肿瘤小众疾病(类固醇诱导的股骨头坏死(SONFH)),还停留“纯生信”水平。再就是无论肿瘤还是非肿瘤,多关注自己疾病方向对应的期刊,这样好命中一些;一对一生信SCI指导(付费),添加个人号kyzd2019请备注:生信SCI(可先...
生信论文75.这是一篇标准的生信筛选、验证 湿实验论文(值得收藏、借鉴和分享)生信筛选论文,跟纯生信论文完全不一样,属于科研论文。对于生信论文,目前大趋势是生信筛选 生信验证 湿实验验证。严格地说,这样的论文已经不是生信论文,而应该叫科研论文。相比于只关注差异表达的基因,WGCNA利用数千或近万个变化最大的基因或全部基因的信息识...
02具有相同受体的BRCA亚型具有共同的IDElncRNA按照 CSCO 亚型分类,TNBC 亚型最具侵袭性并且具有最多的 IDElncRNA,其次是 HER2 /HR - 亚型和 luminal A 亚型(图 2A)。本研究的亚型与 Thorsson 等人的免疫亚型显著相关(图 3C),大多数 TNBC 肿瘤被 Thorsson 等人归类为 C2 免疫亚型,在本研究中,63.6% 的免疫亚型与 C2 重叠,45.5% 的间充...
生信 简单实验:代谢相关预后分析8 案例这篇文章2022年发表在Journal of Translational Medicine上:Identification of molecular subtypes and a novel prognostic model of diffuse large B-cell lymphoma based on a metabolism-associated gene signature。图8.实验验证PHKA1与预后和免疫微环境关系最后我们总结一下:研究共包括7张图,其...
作者首先基于TCGA队列的RNA-seq数据筛选了IL-10 TAMs浸润高低组的差异表达基因(DEGs)并进行GO富集分析,结果观察到免疫抑制相关基因在IL-10 TAMs高浸润组中富集,并参与T细胞增殖和免疫应答的负调控等功能(图3A),此外免疫检查点基因也在IL-10 TAMs高浸润组中上调(图3B)。图3 IL-10 TAMs浸润的免疫逃逸微环境的识别4.在MIBC中通过scRNA-s...
作者旨在构建一个基于MVI相关基因(MVIRGs)的预后模型,可以用于HCC患者的风险评估和预后预测。与正常样本相比,作者将MVI阳性样本中的上调DEGs定义为MVI( ) up组,将MVI阴性样本中的上调DEGs定义为MVI(-)up组。3个MVIRGs单独表达水平与HCC患者生存情况的相关性分析表明,DBF4和SLC16A3高表达与HCC患者的OS较差有关(图3A和3B),ARG2高表达可...
发现CHPF基因在。将免疫细胞差异分析与相关分析结果相交后,共得到10个差异表达的免疫细胞,这10种差异免疫细胞的K-M生存分析显示,其中B细胞记忆、B细胞幼稚、T细胞、CD4记忆静息、巨噬细胞M0、巨噬细胞M1与生存相关,其中巨噬细胞M0、巨噬细胞M1、B细胞记忆与不良预后相关。CHPF基因表达和CHPF DNA甲基化与临床病理参数相关性分析。我们使用G...
载脂肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌中维持肿瘤的生长和侵袭性原文出处:Masetti M, Carriero R, Portale F, et al. Lipid-loaded tumor-associated macrophages sustain tumor growth and invasiveness in prostate cancer. J Exp Med. 2022;219(2):e20210564.研究背景:癌症相关炎症在大多数癌症类型的进展中起着至关重要的作用。MARCO_Mac确定了...
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