分享

cytoscape如何将node置于顶层

 生信交流平台 2023-09-01 发布于上海

前面小编跟大家介绍过绘制生物网络的工具cytoscape
☞ 一网打尽:cytoscape详细教程
☞ cytoscape构建ceRNA网络的输入文件如何制作

    今天小编在绘制网络图的时候遇到一个问题,就是网络的节点数很多,很多节点已经相互重叠在一起了。想要展示每个节点的细节和名字,已经不太现实了,但是又想突出一些比较重要的节点,例如degree最大的核心节点。由于节点确实太多了,导致通过cytohhuba找到的核心节点被其他节点遮挡了。类似于下面这种情况,想突出黄色那个节点。

但是你无论怎么拖动这个节点,似乎总是被其它节点遮挡。甚至有时候,这个点你根本就无法用鼠标去拖动,因为完全被其他节点挡的死死的。最后的解决方法是通过调节这个点的Z-location。有点类似于ppt里面对一些图片的操作,至于顶层和置于底层。

cytoscape官网教程上关于Z location的介绍如下


我们来实操一下,在node的style的properties下拉框中选中Z location

在你关注的这个hub节点处于选中状态下,将其z location值设置的大一些,小编这里设置的是10。

有人会比较好奇,这个点既然都看不到,怎么选中他的。我们可以在右上角的搜索框里面,通过名字搜索你感兴趣的节点

最后你关注的这个node就会置于顶层,没有谁能遮挡它了

    转藏 分享 献花(0

    0条评论

    发表

    请遵守用户 评论公约

    类似文章 更多