大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 此前,我们分享了DNA甲基化研究的测序数据挖掘思路(点击查看详情),进而鉴定出研究的目的基因或目标区域的DNA甲基化。 做完测序后,如果需要对分析结果中感兴趣的内容进行后期验证,则需要进行下游实验设计。DNA甲基化研究的后期验证包括简单验证、全基因组甲基化干扰实验(非靶向)、靶向目标基因的甲基化/去甲基化实验验证等。 一、简单验证
二、全基因组甲基化干扰实验(非靶向)
阿扎胞苷(5-Aza)能够通过与DNA甲基化酶DNMT蛋白家族形成共价键抑制其酶活性,使细胞的DNA甲基化水平降低。
三、靶向目标基因的甲基化/去甲基化实验验证
CRISPR-Cas9靶向编辑DNA甲基化技术 目标区域DNA甲基化的验证手段——Target-BS(靶基因重亚硫酸盐测序)
关于易基因靶基因DNA甲基化测序(Target-BS) 对目标基因/CpG 位点甲基化检测,建立灵活的靶向甲基化测序技术。易基因建立的靶基因甲基化高通量测序(Target Bisulfite sequencing,Target-BS)是针对已有目标基因panel组合,运用易基因自主研发的甲基化特异性多重PCR引物设计软件,对亚硫酸盐转化后的目标基因多重扩增,建库后进行超高深度(1000X以上)甲基化精准检测。 应用方向: Target-BS广泛用于已知位点的甲基化Biomarker筛选、验证及临床转化应用 后续目标基因的甲基化验证 技术优势:
典型案例: Target-BS用于甲基化多位点甲状腺结节诊断 Target-BS发现食管鳞癌甲基化 biomarker 易基因科技提供全面的DNA甲基化研究整体解决方案,技术详情了解请致电易基因。 相关阅读: 项目文章|鸡的chTERT靶基因DNA甲基化检测揭示ALV-J肿瘤发生机制 |
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