National Cancer Institute (NCI)pathway interaction database是一个经过校对的权威通路互作数据库。数据库中收录了322个来自BioCarta和Reactome的通路数据。
并对其进行校对，到2012年9月，已经完成了136个通路的校对过程。除了通路以外，数据库还收录了丰富的通路相关基因信息，便于我们查询基因和通路之间的相关性。
NCI主页地址http://pid.nci./search/#content
在NCI主页上，我们可以看到左侧工具栏，有根据分类浏览通路，根据字母排序浏览通路，高级检索，连接分子搜索，批量查询，下载数据等。中间为数据库统计信息。
到目前为止，数据库收录了来自BioCarta和Reactome的322个通路，其中136个已经完成校对，包括9248个互作关系。下方是搜索界面，我们可以通过分子ID，生物学过程ID进行查询。
例如我们根据通路分类进行浏览，这里NCI讲通路划分为两个大类，即调控通路和信号传导通路，每个大类下又可细分为不同的小类，因此我们可以非常直观的观察出通路之间的从属关系。
在检索过程中，通过help我们可以看到检索模式非常丰富，我们可以通过不同平台的基因命名原则进行查询。
如Entrez id, molecule id, uniprot accession numbers, symbol等等。右侧有三种检索类型，包括高级搜索，连接分子搜索，批量查询。
我们以EGFR为例，可以查询到上述结果页面，第一列为匹配的基因，第二列为通路，第三列为校对信息。可以看到查询到的基因相关通路信息已经全部的到NCI校对。 
对于每一个校对通路结果，我们都可以查询到通路的数据来源，以及校对信息，更新日期，数据类型分类等。同时可以提供不同格式的在线view graphic展示，并且提供两种格式的下载，分别是XML code和BioPAX。
在批量检索过程中，我们可以通过上传具有批量基因列表的文件，然后选择展示的结果，如通路或网络图等。
数据源可以选择NCI校对数据，BioCarta导入的数据， 或Reactome导入数据，需注意，下面两个数据源是未经过校对的。
对于分析结果的输出格式，这里提供了四种选项，分别是JPG,SVG,XML,BioPAX。点击GO即可进行分析。
在批量查询界面，用户可以输入一组由逗号分隔的基因列表。基因的名称可以是多样化的，例如uniprot id, HUGO, gene symbol, entez id, CAS number, compound name等等。
DATA source数据员提供了三种选择，即NCI nature校对数据，或来自BioCarta和Reactome的原始数据。下面是可选的输出格式，包括文件和文本格式。
最后，NCI数据库提供了丰富的数据下载接口，这里可以下载到的数据包括来自BioCarta和Reactome的原始数据，包括level2和level3的。
同时也可以下载经过校对的NCI curated数据。最后用户也可以下载通路ontology注释信息。
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