miRDB通过MirTarget这个软件预测了人,小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息,并将其整理成了数据库,网址如下
该数据库中涵盖的物种如下
每个物种相关的miRNA和靶基因数量统计如下 除了提供软件预测的靶基因结果外,该数据库还做了一个文献整理的工作,将报导了miRNA前体或者成熟miRNA功能的相关文献收集整理,汇总形成了一个miRNA功能数据库,称之为FuncMir, 该数据库包含了人和小鼠这两个物种中的miRNA信息,示意如下 点击红色链接可以查看详细信息和相关的pubmed文献。 1. target search该功能一次只可以检索一个miRNA后者gene, 检索框如下所示 2. target mining该功能用于一次检索多个miRNA或者gene,检索框如下所示 检索结果如下所示 结果会按照 该数据库提供了下载功能,可以方便的下载数据库中的所有信息,示意如下 miRDB本质上是一个软件预测的miRNA靶基因数据库,如果只看这一个数据库,结果的假阳性率会比较高,最好的做法是结合多个软件预测或者数据库的结果,类似 ·end· |
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