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推荐：江舜尧 编译：微遗传 编辑：马莉 2019年5月23日北京大学第一医院生命科学学院张宁、白凡团队以及中山大学肿瘤防治中心曾木圣团队等在《Cancer Cell》杂志在线发表了题为“Genomic and Transcriptomic Profiling of Combined Hepatocellular andIntrahepatic Cholangiocarcinoma Reveals Distinct Molecular Subtypes”的文章。该文章发现肝细胞合并肝内胆管细胞癌（cHCC-ICC）显示的Nestin有更高的表达，表明Nestin可以作为诊断cHCC-ICC的生物标志物，该结果为cHCC-ICC提供了重要的生物学和临床见解。 导读 肝细胞癌（HCC）和肝内胆管癌（ICC）是原发性肝癌（PLC）的两种主要类型，分别占约80％和15％。cHCC-ICC是一种罕见的PLC，研究显示肝细胞和胆管上皮分化发病率在0.4％和14.2％之间变化。与HCC和ICC相比，cHCC-ICC具有更强的侵袭行为和更差的预后。但是，cHCC-ICC没有特异的治疗方法，手术切除仍然是主要的治疗选择，但其益处可以忽略不计。因此迫切需要cHCC-ICC的分子表征以帮助生物标志物研发，促进准确诊断并加速特异疗法的开发。 研究亮点 1.构建了133个cHCC-ICCs的基因组和转录组景观 2.整合基因组分析揭示不同的cHCC-ICCs亚型 3.确定cHCC-ICCs的单克隆和多克隆起源 4.Nestin表达可作为cHCC-ICC诊断和预后的生物标志物 图解摘要 本研究中，他们进行了泛亚多中心研究，涉及8家医院，并对133例cHCC-ICC病例进行了大规模综合分析，包括全外显子组测序（WES），全基因组测序（WGS），RNA测序（RNA- seq）和单核测序（SNS）。根据Allen和Lisa的标准，将cHCC-ICC病例分为三种亚型。具有物理分离和组织学不同病变的病例被定义为分离型（表示为Sep_ID）。在相同肿瘤中具有明确限定的HCC和ICC组分区域的病例被定义为结合型（表示为Com_ID）。在没有明确边界的相同肿瘤中具有紧密混合的HCC和ICC组分的病例被定义为混合型（表示为Mix_ID）。 在121例分类病例中，6例为分离型，56例为结合型，59例为混合型。针对每个亚型设计了不同的处理策略。通过激光捕获显微切割（LCM）在3种单独类型和41种结合型cHCC-ICC病例中收集多个肿瘤样品。病因学上，100例乙型肝炎病毒（HBV）阳性，7例丙型肝炎病毒（HCV）阳性，1例双阳性，25例双阴性。总的来说，除了正常对照外，对来自121例的173个肿瘤样本进行了WES，对来自37个肿瘤的41个肿瘤样本进行了WGS，对来自77个肿瘤的97个肿瘤样本进行了RNA-seq。 WES的平均深度对于肿瘤是108×，对于正常样品是101×。 总结 研究人员对133例cHCC-ICC进行基因组和转录组测序，包括分离型、结合型和混合亚型。cHCC-ICC与肝细胞癌和肝内胆管癌的综合比较显示，结合和混合型cHCC-ICC是具有不同临床和分子特征的不同亚型。整合激光显微切割，癌细胞分数分析和单核测序，研究人员揭示了单独类型cHCC-ICC中的单克隆和多克隆起源，而结合和混合型cHCC-ICC都是单克隆来源。值得注意的是，cHCC-ICC显示的Nestin有更高的表达，表明Nestin可以作为诊断cHCC-ICC的生物标志物。该结果为cHCC-ICC提供了重要的生物学和临床见解。 |
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