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Trizol法提取RNA原理及实验步骤(新手详细注释版)

 小梦想在努力 2020-09-25
Trizol法使用步骤

一、分离纯化的基本原理

研究基因的表达和调控时常常要从组织中分离和纯化RNA。RNA质量的高低常常影响cDNA库,RT-PCR和Northern Blot等分子生物学实验的成败。Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,内含异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放出的核酸酶。 

二、需自备的试剂和材料

无水乙醇、氯仿、1.5ml Eppendorf管(RNase-free)、Tips(RNase-free)

三、准备工作

RNase酶非常稳定,是导致RNA降解最主要的物质。它在一些极端的条件可以暂时失活,但限制因素去除后有迅速复性。用常规的高温高压蒸气灭菌方法和蛋白抑制剂都不能是RNase完全失活。它广泛存在于人的皮肤上,因此,在与RNA制备有关的分子生物学实验时,必须戴手套

   RNase的又一污染源是取液器,根据取液器制造商的要求对取液器进行处理。一般情况下采用用DEPC(焦炭酸二磷脂,一种RNase抑制剂)配制的70%乙醇擦洗取液器的内部和外部,基本达到要求。取RNase-free的物品时必须戴手套。

      1、 塑料制品的处理

      尽可能使用无菌,一次性塑料制品,已标明RNase-Free的塑料制品,如没有开封使用过通常没有必要再次处理。对于国产塑料制品,原则上都必须处理方可使用。处理步骤如下: 

1)在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使DEPC的终浓度为0.1%。注意:DEPC为剧毒物,活性很强,小心在通风柜中使用。

2)处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中,注入DEPC水溶液,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中。

3)在通风柜中室温处理过夜。

4)将DEPC水溶液小心倒到废液瓶中,用铝箔封住含已DEPC水处理过的塑料制品的烧杯,高温高压蒸气灭菌至少30分钟。

5)烘箱用合适的温度烘拷至干燥。置于干净处备用。

    2、 璃玻和金属物品

250°C高压灭菌烘烤3小时以上。

四、从组织中提取总RNA步骤

1)液氮研磨:组织块直接放入研钵中,加入少量液氮,迅速研磨,待组织变软,再加少量液氮,再研磨,如此三次,按50-100mg组织/ml Trizol加入Trizol,转入离心管进行第2步操作。

(液氮既能使各种组织成分不易被破坏或降解,又能使组织变硬,脆性增加易于磨碎。终止细胞内外一切生物反应,防止RNA酶的降解反应)

2) 匀浆:组织样品按50-100mg/mlTrizol加入Trizol。另外,组织体积不能超过Trizol体积的10%,否则匀浆效果会不好,用电动匀浆器充分匀浆约需1-2分钟。

3) 加Trizol后,室温放置5min,使其充分裂解。注:此时可放入-70℃长期保持。

4) 12,000rpm 离心5min,弃沉淀。

5) 按200ul氯仿/ml Trizol加入氯仿,振荡混匀后室温放置15min。注:禁用漩涡振荡器,以免基因组DNA断裂。

(氯仿为有机溶剂,有效的使有机相和无机相迅速分离。有机相中主要是酚和蛋白结合,从而使得蛋白和RNA脱离,RNA进入水相)

6) 4℃ 12,000g离心15min。

7) 吸取上层水相,至另一离心管中。注:千万不要吸取中间界面;若同时提取DNA和蛋白质,则保留下层酚相存于4℃冰箱,若只提RNA,则弃下层酚相。

8) 按0.5ml异丙醇/ml Trizol 加入异丙醇(沉淀RNA)混匀,室温放置5-10min。

9) 4℃ 12,000g离心10min,弃上清,RNA沉于管底。

10) 按1ml 75%乙醇/ml Trizol加入75%乙醇(沉淀RNA),温和振荡离心管,悬浮沉淀。

11)  4℃8,000g离心5min,尽量弃上清。

12) 室温晾干或真空干燥5-10min。注:RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解。

13) 可用50ul H2O,TE buffer或0.5%SDS溶解RNA样品,55-60℃,5-10min。注:H2O、TE或0.5%SDS均须用DEPC处理并高压。

(TE缓冲液由Tris和EDTA配制而成,主要用于溶解核酸,能稳定储存DNA和RNA。用于酶切反应不能使用SDS)

14) 测O.D值定量RNA浓度。注:此方法提取RNA A260/A280值在1.6-1.8之间;

电泳检测:1%琼脂糖,1×TEA缓冲液,90V电泳30min,凝胶成像系统观察,分析结果。

注:组织过少,可酌情减少Trizol用量;组织用量过多,会引起DNA对RNA的污染;热天提RNA,带手套是必须的,手是RNase的主要来源; 

注明:本文整理自网络

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