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day6trizol法提取RNA全集合(材料-步骤-原理)

 小梦想在努力 2020-09-25

好的字体和排版是优秀公众号本来的属性,只是自己忽略了。这次决定改一下公众号字体和排版了,之前的太丑,不忍直视

搜索了一下微信,看到 凉风有刃 公众号这篇文章,教直接复制就会保留文字的格式,这么简单??

什么是好的设计之公众号字体和字体排版

突然觉得改变也不是太难的事,如果你愿意去做,最后它会给你惊喜

好了,今天来讲一下 trizol法提取RNA那些事


之前一直埋头做实验,就听师兄说,没有理解原理就去做了实验,结果却总不理想,直到前天上生物信息学课,遇到一学霸,非常详细地给一同学介绍q-PCR ,从原理到用材用量,惊呆到了,所以昨天狠心下来去了解个透(说明多交流,你会学到不一样的经历的)

1.详细步骤:

材料:

Trizol ,氯仿,异丙醇,75% 乙醇(用RNase-Free 水配制), RNase-Free 水,EDTA抗凝管。废弃缸,1.5ml EP管,EP管+抗凝管的托,大、中、小号枪和枪头、纸巾、棉花、手套

步骤:

300ul 全血+1ml TRIzol(充分吹打混匀, 室温静置5min(使核酸蛋白复合物完全分离) 

+200ul的氯仿(静置5min ,离心=12000g, 4℃,15min) 取上层上清液,转移到1.5ml EP 管中, 

加500ul的异丙醇,(上下颠倒混匀10s,室温静置10min ,离心12000g, 4℃, 10min ,弃上清)

 +1ml 75%乙醇,上下颠倒混匀10s,离心7500g, 4℃, 10min ,弃上清

 室温下干燥5-10min (充分干燥不好溶解),加入11 ul的 RNase-free-water (充分溶解RNA )

检测质量

260 nm、230 nm、280 nm的吸光度分别代表了核酸、盐浓度和蛋白质等有机物的吸光度值

分光光度计测OD值(取2μ l 进行电泳,其余-80℃保存 )

 ▲分光光度计检测质量取出2 ul定量,测量buffer: 10mM TrisCl(pH7.8)。A260/A280=1.8~2.1 此公式体现了RNA中蛋白质等有机物的污染程度,质量较好的RNA的R值应在1.8-2.2间

 A260/A280<1.8, 说明蛋白质等有机物的污染比较明显

A260/A280>2.1,说明RNA存在降解,已经被水解成了单核苷酸

PS:

1.先加试剂,再加标本,实验会快一点   

2.标本标签:术后标2,术前标1    

3.师姐建议:

1.可加入与上清液等体积异丙醇;500-500 

2.酒精洗涤2次; 

3.加入异丙醇离心后,每管加300μl酒精,震荡至沉淀漂浮,然后再汇合成一管,离心5分钟,去上清,再加入1000ul酒精,再震荡至沉淀漂浮,再次离心5分钟。

4.干燥5分钟左右,不要让沉淀太干

2.原理

也是昨晚看的公众号文章,分子君爱生活  Mega18  两个公众号

提取RNA时小伙伴们应该掌握哪些原理(方法 TRIzol法 上)

提取那点事-RNA

以下引用公众号:分子君爱生活 

第一个试剂:TRIzoI,它的功能是使细胞充分裂解,溶解胞内含物,注意这一点就开始使RNA提取更纯的一个初始保证,同时又因为它里面含有RNαse抑制剂(就是RNA酶抑制剂,RNA酶很好理解是分解RNA酶的,我们提取RNA最讨厌遇到它),能保持RNA的完整性。

第二个试剂:用三氯甲烷(即氯仿),有毒,有强烈气味,需在通风厨内操作。加入氯仿,是因为氯仿是分子量较大的有机溶剂,可使有机相和无机相分离。DNA提取过程中,有机相中主要是酚和蛋白结合,从而使得蛋白和DNA脱离,DNA进入无机相(即水相中),但在提RNA时就应该避免它们两脱离,否则DNA会释放到水相,污染RNA,而氯仿本身对蛋白也有变性作用,剧烈震动会导致DNA的亲水基团,与水相接触,所以不要剧烈震动。

第三个试剂:异丙醇,具有-0H疏水性使RNA或DNA链中的亲水基团沉淀,也有沉淀核酸的作用

3.常见问题

公众号文章,AtaGenix公众号

用Trizol 法是这样提取RNA的? Yes!

一枚在读研究生的碎碎日常

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