【原】massarray法的优缺点

massarray法的优势

　　相对于其它SNP检测方法，massarray法的优势有很多：

　　1)靠谱准确

　　PCR+质谱，原理经典简单，仪器稳定灵敏，检测标的为质量变化，比基于碱基互补配对的探针杂交、基于溶解曲线的HRM检测标的更加绝对，原理更加坚实，结论更加可靠。

　　2)更灵敏

　　可以检测5%的SNP，够用。基于PCR+Sanger测序的检测方法难以达到。

　　3)对序列要求低

　　这点主要是与基于限制性内切酶的PCR-RFLP对比来的。

　　4)通量高

　　对比单次反应检测一个SNP位点的Sanger测序和ARMS-PCR、受限于荧光通道的探针杂交和ARMS-PCR，单管检测40个SNP的massarray通量够高。

　　5)速度快

　　单管检测仅需几秒。

　　6)性价比高

　　NGS当然可以检测SNP，但每个样本仅检测几十到上百的SNP位点，且样本量在百千数量级，从数据冗余、时间和金钱方面来看，NGS的性价比都太低!

　　7)更灵活

　　NGS必须凑够样本数量才能充分利用每次上机得到的数据量，从数据量角度，Massarray没有单次检测的最低样本数要求。

　　除此之外，massarray法也有一定的缺点：

　　1，需要特殊的仪器设备;

　　2，不能检测未知的突变;

　　3，每次检测样本和位点数有一定要求。

massarray法的优势

　　相对于其它SNP检测方法，massarray法的优势有很多：

　　1)靠谱准确

　　PCR+质谱，原理经典简单，仪器稳定灵敏，检测标的为质量变化，比基于碱基互补配对的探针杂交、基于溶解曲线的HRM检测标的更加绝对，原理更加坚实，结论更加可靠。

　　2)更灵敏

　　可以检测5%的SNP，够用。基于PCR+Sanger测序的检测方法难以达到。

　　3)对序列要求低

　　这点主要是与基于限制性内切酶的PCR-RFLP对比来的。

　　4)通量高

　　对比单次反应检测一个SNP位点的Sanger测序和ARMS-PCR、受限于荧光通道的探针杂交和ARMS-PCR，单管检测40个SNP的massarray通量够高。

　　5)速度快

　　单管检测仅需几秒。

　　6)性价比高

　　NGS当然可以检测SNP，但每个样本仅检测几十到上百的SNP位点，且样本量在百千数量级，从数据冗余、时间和金钱方面来看，NGS的性价比都太低!

　　7)更灵活

　　NGS必须凑够样本数量才能充分利用每次上机得到的数据量，从数据量角度，Massarray没有单次检测的最低样本数要求。

　　除此之外，massarray法也有一定的缺点：

　　1，需要特殊的仪器设备;

　　2，不能检测未知的突变;

　　3，每次检测样本和位点数有一定要求。