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生信小白送你超级好用的基因功能富集工具

 生信漫谈 2023-07-29 发布于湖北


    在文献中常常看到下图这样一个基因功能富集分析气泡图,涉及到的功能注释数据库除了常见的GO和KEGG最重要的是图挺好看的,于是一直寻找相应的分析作图工具。

偶然找到了这个工具!没错,它就是g:Profiler中的g:GOSt小工具

https://biit.cs./gprofiler/gost

1、工具首页:


2、使用g:GOSt进行基因功能富集的方法很简单,将自己感兴趣的基因集(如差异基因集)复制粘贴到输入窗口中,然后选择相应的物种(Organism),其他参数保持默认,只需点击Run query按钮即可。

3、上传的物种的ID 选择很多,植物,动物都有,都能满足你的需求。


4、可以根据自己选择设置P值。

5、结果分析,类似于GWAS的曼哈顿图。

6、在结果区域点击Detailed Results选项,可以具体看到富集的GO terms的富集情况。



还有一个新发现超级好用的功能基因ID转换,真是超级方便:

1、输入目的ID,需要转换的格式。


2、输出结果。


    gprofiler在线网站基因功能富集工具的功能介绍到这里,作图超级方便,希望大家喜欢。

   今天就先给大家介绍到这里,希望大家的科研能有所帮助!祝您科研顺利快乐!




图片:来自网络

文章:来自网络

排版:生信小白



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