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【LorMe周刊】批判性评估噬菌体在塑造微生物群落组成中的相对重要性。此外，温和噬菌体 (生活史涉及整合宿主染色体并垂直传播的噬菌体) 和烈性噬菌体 (专性杀死宿主的噬菌体) 都可以通过强化选择发挥重要的间接进化作用。3、噬菌体并不总是塑造微生物群落组成作者认为支撑噬菌体在塑造微生物群落中作用的证据参差不齐，研究表明在自然界中各种... 阅1 转0 评0 公众公开 24-04-30 16:18 |
二、细菌群落对小麦多周期种植和AG8侵染的响应不同小麦种植周期和病原真菌AG8侵染条件下，细菌群落呈现明显聚集的现象（图4）。在本研究中，作者使用多循环选择系统和病原菌立枯丝核菌的入侵来探究植物根际招募有益菌抑制病害发生的行为，结果发现，连续种植显著增强了AG8敏感型小麦的抑病性，且AG8入侵与非入侵的小麦根际微生物组不同，且病害... 阅2 转0 评0 公众公开 24-04-29 15:09 |
为了验证这一假设，作者给被抗生素清除了肠道菌群的无菌小鼠分别接种BtWT和BtΔxusB、BtWT和ΔxusBxusBC23A，两天后灌胃沙门氏菌野生型和不能产生铁载体的S.TmΔentB（图4A），四天后测定肠道的Bt和S.Tm的丰度，发现沙门氏菌感染期间肠道内铁含量降低（图4B），且在野生型沙门氏菌感染条件下，BtWT比BtΔxusB或BtΔxusB xusBC23A更具竞争优势，... 阅4 转0 评0 公众公开 24-04-22 14:12 |
所有进化终点菌株的生物量产量显著低于iTCA菌株 (图1c)，而这4种进化菌株的葡萄糖摄取速率显著高于iTCA菌株 (图1d)。TCA循环缺陷型大肠杆菌作为高效的好氧发酵底盘微生物为证明TCA循环缺陷型DDPYM可以作为好氧发酵的通用和高效的底盘菌株，而不需要琥珀酰辅酶A进行氨基酸 (甲硫氨酸、meso-DAP和赖氨酸) 生物合成，构建了缺失琥珀酰辅酶A合成途... 阅4 转0 评0 公众公开 24-04-17 16:12 |
作者利用反向遗传学和扩增子测序研究发现，茉莉酸甲酯（MeJA）是植物根系产生的关键VOCs，可促进周围土壤中复杂微生物生物膜的形成，并影响了细菌的生长和组成。此外，作者研究发现MeJA还可诱导微生物在植物根部的定植，微生物响应MeJA信号并以多种方式增强微生物群落功能，其中约80%的微生物响应了MeJA信号，这可能吸引有害微生物或破坏有益微... 阅8 转0 评0 公众公开 24-04-13 14:06 |
研究表明，土壤和植物微生物群能影响疾病的发生，通过支持或抑制病原体、影响植物的生理和免疫反应来保护植物。2. 气候变化、植物微生物组和病害植物微生物组对气候变化的反应也会间接影响疾病的发生率。面对气候变化，作者提出了四种植物微生物群的反应情景：a, 在气候变化前，植物依靠复杂的机制（如免疫反应、根系分泌和激素平衡）与土壤中... 阅3 转0 评0 公众公开 24-04-12 14:09 |
主要结果1. SIDERITE概述铁载体信息数据库(SIDERITE，http://siderite.bdainformatics.org)包含了872条记录，涵盖了截至2023年5月已知的所有铁载体，SIDERITE以SMILES格式记录了铁载体结构，将铁载体数字化使得计算分析成为可能。F.铁载体分子量分布2. 铁载体的结构相似性聚类已知铁载体表现出显著的结构多样性。4. 用基于功能基团的方法发现潜... 阅3 转0 评0 公众公开 24-04-09 10:09 |
【LorMe成果】CFViSA：多组学生物信息分析综合平台。CFViSA操作步骤概览CFViSA实用案例。CFViSA可视化示例。A: CFViSA微生物组分析案例：不同植物病害抗性表型茄子根际微生物差异分析，包括α多样性的箱线图、群落的主坐标分析、群落组成柱状图以及STAMP差异分析。B: CFViSA转录组分析案例：昆虫不同阶段转录组差异分析，包括共享和特有基因的V... 阅5 转0 评0 公众公开 24-04-05 14:21 |
【LorMe周刊】噬菌体新应用：基于靶向核酸内切酶介导荧光生物传感器的病原菌检测。主要结果1.AFPAM生物传感器对沙门氏菌检测的主要证据机器视觉-学习辅助的噬菌体与CbAgo介导的荧光生物传感器检测活性沙门氏菌的机制如方案1所示。AFPAM生物传感器对沙门氏菌检测的实际样本分析为评估AFPAM生物传感器在复杂食品样品中检测沙门氏菌的可行性，向无... 阅3 转0 评0 公众公开 24-03-19 14:39 |
【LorMe周刊】P. putredinis NO1激发新型木质素酶活性。这些高度上调的基因包括编码102种推定的CAZy蛋白的基因;47种糖苷水解酶(GH)基因、41种辅助活性酶(AA)基因、10种碳水化合物酯酶(CE)基因和1种多糖裂解酶(PL)基因，其中大部分在生长4 d后上调(图2)，与P. putredinis NO1培养上清中观察到的酶活性峰值一致。译名：木质纤维素水解酶的多组学... 阅4 转0 评0 公众公开 24-03-14 15:09 |
