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今天我们来理一下关于增强子研究相关的经典综述。 1.The role of enhancers in cancer. Nat. Rev. Cancer 2016 08;16(8) 这篇综述发表于2016年，说的是增强子在肿瘤里面的作用及作为治疗靶点的可能性。 控制基因表达的调控元件和鉴定的Marker 这里出现了四个概念：启动子（promoter）、增强子（enhancer）、超级增强子（super-enhancer）和绝缘子（insulator），其中增强子的概念我们已经介绍过了。 超级增强子：超级增强子（Super-enhancer）是基因组中大量增强子富集的转录调控区域，能够大幅度地激活基因的表达，且具有较高的组织特异性，在发育、癌症等过程中均扮演着重要的角色。从序列长度上讲，超级增强子的序列长度要远大于一般增强子，比如在黑色素瘤细胞中，超级增强子的序列平均（median）长度为19.4kb，而一般增强子的序列平均（median）长度是1.3kb。 绝缘子：绝缘子(insulator)长约几百个核苷酸对，是通常位于启动子同正调控元件(增强子)或负调控因子(为异染色质)之间的一种调控序列。绝缘子本身对基因的表达既没有正效应，也没有负效应，其作用只是不让其他调控元件对基因的活化效应或失活效应发生作用。 增强子/超级增强子的活性是肿瘤或者细胞特异性的 上图中可以看到同样是调控MYC表达，在胰腺癌、T细胞急性淋系白血病和结直肠癌中的增强子/超级增强子序列是不同的。 生殖系（Germline）变异和体细胞（somatic）突变调控增强子活性和基因表达 促癌和谱系特异性转录因子联合调控基因表达 2. Lingering Questions about Enhancer RNA and Enhancer Transcription-Coupled Genomic Instability.Trends Genet. 2017 02;33(2) 这是一篇2017年发表的综述，主要探讨的主题是：增强子RNA（enhancer RNA，eRNA）和转录如何调控基因组稳定性和拓扑结构。 增强子RNA（enhancer RNA，eRNA），是由增强子转录产生的RNA。eRNAs可以激活增强子活性，也能与其它蛋白质因子结合促进增强子启动子环的形成，从而激活下游基因的表达,它还可能以独立的形式发挥某些生物学功能。 增强子RNA（eRNA）的产生和不同作用方式 3.Enhancers as non-coding RNA transcription units: recent insights and future perspectives.Nat. Rev. Genet. 2016 Apr;17(4) 与上篇综述类似，这篇文章的一个重要主题也是增强子RNA（eRNA）。 增强子活化的过程 增强子的转录和eRNA的产生 增强子转录在基因表达调控中的作用
增强子转录和eRNA的生物学意义 4. Enhancer Logic and Mechanics in Development and Disease.Trends Cell Biol. 2018 Aug;28(8)
在这篇文章中，主要从发育和疾病的角度介绍了增强子的研究方法和作用机制，比如增强子鉴定的各种方法，比如STARR-seq,3C,4C,5C等：
果蝇中，增强子对基因表达的调控 5.Enhancer dysfunction in leukemia.Blood 2018 Apr 19;131(16)这篇综述主要介绍的是白血病中增强子的功能异常，比如增强子的改变研究：
增强子异常调控的机制
3号染色体翻转或转位导致增强子异常促进AML 好的，今天就先介绍这几篇综述和几个新概念。 |
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