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质粒的提取方法

 最后的大肠杆菌 2019-07-10
碱裂解法提取质粒DNA操作步骤
(1) 挑取LB固体培养基上生长的单菌落,接种于20ml LB(含Amp100ug/ml)液体培养基中,37℃、250rmp振荡培养过夜(约12-14hr)。
(2) 取1.5ml培养液倒入1.5ml eppendorf管中,12000rmp离心1-2min。弃上清,将离心管倒置于卫生纸上,使液体尽可能流尽。
(3) 菌体沉淀重悬浮于100μl溶液Ⅰ中(需剧烈振荡,使菌体分散混匀。),室温下放置5-10 min。
(4) 加入新配制的溶液Ⅱ200μl,盖紧管口,快速温和颠倒eppendorf管数次,以混匀内容物(千万不要振荡),冰浴5 min,使细胞膜裂解(溶液Ⅱ为裂解液,故离心管中菌液逐渐变清)。
(5) 加入150μl预冷的溶液Ⅲ,盖紧管口,将管温和颠倒数次混匀,见白色絮状沉淀,可在冰上放置5min。 12000rmp离心10min。溶液Ⅲ为中和溶液,此时质粒DNA复性,染色体和蛋白质不可逆变性,形成不可溶复合物,同时K+使SDS-蛋白复合物沉淀。
(6) 上清液移入干净eppendorf管中,加入等体积的酚/氯仿/异戊醇,振荡混匀, 12000rmp离心10min。(450μl的苯酚/氯仿/异
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戊醇)
(7) 小心移出上清于一新微量离心管中,加入2倍体积预冷的无水乙醇,混匀,室温放置 2-5min,离心12000rmp×10min。
(8) 弃上清,将管口敞开倒置于卫生纸上使所有液体流出,加入1ml 70%乙醇洗沉淀一次,12000rmp离心5 min。
(9) 吸除上清液,将管倒置于卫生纸上使液体流尽,室温干燥。
(10) 将沉淀溶于20μl TE缓冲液(pH8.0,含20μg /ml RnaseA,约4μl)中,37℃水浴30min以降解RNA分子,储于-20℃冰箱中。
2.10.2 实验试剂及配制:
(1) LB液体培养基
称取蛋白胨(Tryptone)10 g,酵母提取物(Yeast extract) 5g,NaCl 10g,溶于800ml蒸馏水中,用NaOH调pH至7.5,加水至总体积1升,高压下蒸气灭菌15分钟。
(2) 氨苄青霉素(Ampicillin, Amp)母液:配成 100mg/ml水溶液,-20℃保存备用。
(3) 溶液Ⅰ
50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0)。
配制方法:1M Tris-HCl(pH 8.0)12.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml。在121℃高压灭菌15min ,贮存于4℃。
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(4) 溶液Ⅱ
0.2M NaOH,1% SDS
配制方法:2M NaOH 1ml,10%SDS 1ml,加ddH2O至10ml。使用前临时配置。
(5) 溶液Ⅲ:
醋酸钾(KAc)缓冲液,pH 4.8
配制方法:5M KAc 300ml,冰醋酸 57.5ml,加ddH2O至500ml。4℃保存备用。
(6) 苯酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)
氯仿可使蛋白变性并有助于液相与有机相的分开,异戊醇则可起消除抽提过程中出现的泡沫。酚和氯仿均有很强的腐蚀性,操作时应戴手套。
(7) 无水乙醇
(8) 70%乙醇
(9) TE:10mM Tris-HCl(pH 8.0),1mM EDTA(pH 8.0)。
配制方法:1M Tris-HCl(pH 8.0)1ml,0.5M EDTA(pH 8.0)0.2ml,加ddH2O至100ml。121℃高压湿热灭菌20min,4℃保存备用。
1M Tris-HCl(Tris(三羟甲基)氨基甲烷)配制:800ml H2O中溶解 121g Tris碱,用浓盐酸调pH值,混匀后加水到1L。
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0.5M EDTA(乙二胺四乙酸):700mlH2O中溶解186.1g Na2EDTA.2H2O,用10M NaOH调 pH8.0(需约50ml),补H2O到 1L。
(10) RNA酶A母液:
将RNA酶A溶于10mmol/L Tris·Cl(pH7.5), 15mmol/L NaCl中,配成10mg/ml的溶液,于100℃加热15分钟,使混有的DNA酶失活。冷却后用1.5ml eppendorf管分装成小份保存于-20℃。

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