摘者注，人体对于现代解剖学，从结构上看好像是白箱，但也是相对的，实质上微观上还是黑箱。但从人体生命运行机制和内部机理上仍然是不折不扣的黑箱。司外揣内的黑箱方法是认识人体生命的基本方法。司外揣内是生命科学研究的最原始最基本的研究方法。
中医学在研究人体生理和病理的时候，大量使用了“黑箱方法”。就好像老农挑西瓜，以不打开西瓜为前提，推测西瓜的内部情况。这时就要观察西瓜的外部特征，需要摸手的感觉和敲声响，收集一些反应出来的信息，进行判断，这就是“黑箱方法”。这个方法，在日常生活里是经常被运用的，不仅中医判断病情要用它，就是屠夫买猪贩牛，农民种地养花，军人了解敌情，门卫询问来客，也离不了黑箱方法。但是，把这种方法上升到理论高度，能够融入现代科技体系之内，就不是一般人所能做到的。
对于内部结构尚不能直接观测，只能从外部去认识的客体，控制论创始人维纳起先称它为“闭盒”(Closed Box)，后来艾什比、维纳又称它为“黑箱”(Black Box，又译为“暗盒”)。当然，黑箱的概念是相对的。买到手的西瓜，回到家里切开吃，就把黑箱变成了“白箱”；今天无法了解的内部情况，日后手段进步而真相大白的时候，也就把黑箱变成了白箱。
研究黑箱形成了认识论和方法论的重要课题，由此发展成一种研究事物的黑箱方法，形成了黑箱理论。中医学经过长期的探索，逐渐熟悉了人体的各种功能，创立了脏腑经络学说，总结出一套通过望、闻、切、问了解病情，根据外在证候辨证施治的诊疗技术和理论，就是运用黑箱方法的典型，只是当时“有其实而无其名”。
控制论黑箱方法一般包括3个基本步骤：确认黑箱、考察黑箱、阐明黑箱。即利用系统的输入、输出，观测试验的数据，参考原先对系统的知识，建立研究对象的模型(框图模型、动态登记表，数学模型等)，然后对系统的功能特性，进行定性、定量和静态、动态的分析评价，对系统的未来行为做出某种预测，对系统的内部结构和机理做出某些推测和假说。这就是系统辨识。
其实，现实生活里完全的黑箱与白箱，都是不常见的，常见的是“灰箱”。“灰箱”就是“半知半不知”，而且随着认识的深入，原来以为是白箱的事物，就变成了黑箱或者灰箱。
《灵枢·经水》说：“八尺之士，皮肉在此，外可度量切循而得之，其死可解剖而视之。其藏之坚脆，腑之大小，谷之多少，脉之长短，血之清浊，气之多少，十二经之多血少气，与其少血多气，与其皆多血气，与其皆少血气，皆有大数。”在肉眼可见的标准下，《内经》作者对于人体的认识是很自信的。《难经》作者也把各脏腑的大小长短、厚薄重量称量出来，显然他们自己认为对于人体的认识处于“白箱水平”。然而，西方医学的传入，首先使王清任为代表的一批中医学家丧失了对于人体解剖的自信，认为经典对于人体的认识，至多是一个“灰箱”，绝对不属于白箱水平。
西医靠着解剖与化验的精细、实证，在进军中国的时候得心应手，所到之处不仅“如入无人之境”，而且“海归派”学者为之鸣锣开道，中医的处境陷入了困难。其实，解剖化验的精细与实证，仅仅是一个“模型”，充其量只是一个标准的“虚拟人体”结构，而不是每一个医生所面对的具体患者的“白箱展示”。
其实，一个人无论患了什么病，他（她）体内的组织结构、物理化学变化的细节是不可能完全“白箱化”的。比如，中医说的胸痹，西医诊断为冠状动脉硬化性心脏病，可以通过心导管造影，或者开胸探查，明确地看到局部的粥样斑块，似乎已经达到了白箱水平。但是，这个斑块内部的结构如何？它的稳定性怎样？何时将会发生冠脉事件？这个人的斑块是如何形成的？始动因素是什么？现有影响疾病转归的因素有多少？到底如何治疗才是最佳的选择？如此等等的疑问，在只能证实“有病灶”可见的白箱里，都是未知数。那么，这个所谓的白箱诊断，也就成了黑箱，至多是一个灰箱。
微生物感染引起的呼吸道炎症，按道理说，治疗应该有针对性，不仅要区分是细菌还是病毒，而且要培养这个细菌，得出它对于何种抗生素最敏感？需要多大剂量的药物才既不多用，又不少用？精确度是以克为单位，还是以毫克为单位？这样“白箱水平”的治疗，世界上还没有一家医院可以做到。针对病毒感染的“分子靶向”药物，如果能够做到的话，几乎难于登天。临床医生面对病人的紧急病情，也不允许达到最精细的白箱水平。所以，世界上最现代化的西医医院，其治疗的实际状况也是“灰箱水平”。
中医对于脏腑解剖的认识，尽管不是十分精细，但是已经达到“确有其物”的程度，不是向壁虚造，已经属于灰箱水平的认识。中医对于人体升降出入的认识，尽管没有物理化学分子水平的描述，但是其气血循环、水谷代谢、津液输布的理论认识，都是“大体不错”的灰箱水平知识。而且这种灰箱水平知识，与中药方剂理论关于药物气味、升降浮沉、寒热归经的灰箱水平知识，是互相匹配的，可以丝丝入扣地密切契合，彼此互动，达到自洽，取得良好疗效。
如果抛开中医的灰箱理法方药知识，必须以分子水平为标准白箱，那么，中医所说的辨证论治的物质基础，中医所运用方药的分子机制，将会成为天文数字的海量数据，既不便于“客观化”，也是大量社会资源毫无意义的浪费，病人与医生更是无法从中得到明晰的认识。
面对黑箱的时候，中医不会无奈；面对灰箱，我们应该更有信心。
“丸散膏丹，神仙难辨”的“合而治之”，其背后有着“一揽子解决”的智慧；单一化学成分的靶点治疗，“分而治之”尽管方便快捷，但是简单应对“可重复性强”的背后，却控制不了“一因多果”，或者“多因一果”的复杂局面。
